选择手术来治疗效果都比较好，发病原因主要是由于内分泌失调导致的。应该先去医院做一下病理检测。看看疾病的严重情况，根据不同的情况选择不同的治疗方案，平时一定要注意卫生，不要吃油性食物。
需要4个-5个疗程。女性在卵巢巧克力囊肿术后，除了要进行定期的复查工作外，还需要调整自己的情绪，同时要注意避免感寒着凉。女性在卵巢巧克力囊肿术后进行正确的护理工作，可以让病人的身体得到更为有效的改善。
去专业正规的医院进行检查和治疗，遵医嘱用药。尽量吃清淡一点，要忌生冷和茶。个人的卫生习惯也很重要，内衣勤洗勤换。多用开水烫洗然后放在太阳底下暴晒。保证良好的作息，不要太晚睡觉。
巧克力囊肿的复发几率还是非常高的。在临床上，如果巧克力囊肿的病人术后没有给予相应的干预，绝大多数都会出现复发的情况。主要是因为巧克力囊肿由具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢，才引起的这种囊肿，手术很难把这种活性细胞完全根除掉，所以就会复发。
巧克力囊肿的治疗方法可采用药物或手术治疗。除了手术外，尚无一种理想的方法。手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是本病的处理方法。饮食要多注意一点，不要吃辛辣食物。
需要三个月左右才能治好。巧克力囊肿是子宫囊肿的一种，属于良性病变，会伴随有增生、转移、复发等情况的出现，而且会造成痛经、月经失调等，因此建议还是及早治疗比较好，需要服药三个月左右进行巩固治疗，另外需要随时复查。