肾脏结石通常会造成腰痛，由于肾脏的炎症和阻塞，会造成腰酸，但其类型和持续的时间要视病情而定。
如果是小型的胆囊结石引起的急性阻塞，患者会有腰腹部的剧痛，通常以绞痛为主。如果患者是由于结石所致的炎症，患者会有腰部的痛苦，这种痛苦会一直存在，并且会非常强烈，并且会造成患者的尿痛，即排尿时的痛苦，如果是结石堵塞的话，则会有腰部的酸痛。
肾结石痛在哪个部位，需要视情况而定，具体分析如下：
肾脏结石疼痛通常发生在腰椎2侧和12肋骨下。肾结石的疼痛主要是由于肾绞痛引起的，它是由腰部开始，沿着输尿管一直到膀胱。如果疼痛比较严重，可以服用一些镇痛的药物，比如黄体酮，杜冷丁。如果是小结石，可以通过多饮水和运动来排出，如果出现肾绞痛经常发作，建议进行体外碎石。
当肾结石嵌入输尿管的一部分时，会引起腰椎的剧烈疼痛。如果结石较大，药物治疗效果不明显。结石小于5mm时，可服用药物治疗。锻炼可以促进结石排出，喝水可使尿液稀释晶体盐在体内降低其浓度，从而有效地防止结石的形成。
肾结石如果在肾里不移动，可以没有任何症状，如果结石在肾里移动，或者石头由肾里掉到输尿管，造成肾的疼痛。呈钝痛，结石在肾里刺激肾脏出现腰痛，有人甚至有血尿等症状。
肾结石疼痛部位主要表现在腰背部疼痛为主，具体位于腰椎及肋骨的交叉处，疼痛比较剧烈，会有恶心、呕吐，部分病人有腰背部胀痛的感觉。如果结石位于肾盂及输尿管上段，表现就是输尿管嵌顿区域绞痛，伴有明显的恶心，呕吐，尿频，尿急及血尿等。如位于输尿管下段，疼痛向会阴部或者大腿根内侧放射。
结合病人的情况为肾结石疾病，可以出现腹部疼痛及肾区的疼痛，需要采取彩超检查证实的，其次就是需要采取静脉肾炎的检查，出现积水需要采取手术治疗的，其次就是需要采取碎石处理的。