急性附睾炎是由病原体感染所致，国外有研究认为，35岁以前的附睾炎多在性交后感染沙眼衣原体和淋球菌等病原体导致，而35岁以上的附睾炎则多由非性传播的革兰阴性肠道杆菌引起的尿道感染所致。
当各种原因导致自身抵抗力降低时，病原菌可以趁机侵入附睾引发炎症，附睾炎按病程可分为急性附睾炎和慢性附睾炎两种。最多见是流行性腮腺炎病毒，这种病原体主要侵犯儿童的腮腺，引起大嘴巴病，但是，这种病毒也嗜好于侵犯睾丸。
急性附睾炎为附睾的非特异性感染，是阴囊内最常见的感染性疾病。多由于后尿道炎、前列腺炎及精囊炎沿输精管逆行感染所致，对于急性附睾炎主张卧床休息，托起阴囊，以减轻疼痛。早期可将冰袋放在附睾处，防止肿胀。晚期可用热敷，以促进局部血运，加速炎症消退。因属于感染，故应进行抗感染治疗，临床上多选用广谱抗生素及对革兰氏阴性菌效果较佳的抗生素。
阴囊内疼痛常突然发生，可沿精索放射至腹股沟区及腰骶部，疼痛通常较重，触痛明显拒按，可以出现尿频，尿急，尿痛，腰部疼痛，发热等全身症状，仅仅是应当可以早期冷敷，此后可以热敷以及温水坐浴，并选用敏感的抗菌药物，疼痛明显时，还可以做局部的封闭治疗。
附睾炎是泌尿外科常见病，可以分为急性和慢性附睾炎。慢性附睾炎常常在附睾可以触摸到硬块结节。如果没有不适症状，可以不治疗，定期观察。如果反复疼痛，而且伴有阴囊坠胀不适，病程超过半年以上，药物治疗效果不好，则需要手术治疗。特别是对于已婚已育的人，可以做附睾切除术。
附睾炎早期是一种蜂窝织炎，在输精管开始再延伸至附睾尾部。在急性期，附睾肿胀高低不平。感染从附睾尾延至附睾头。此时如切开附睾可见小脓肿，鞘膜分泌液可呈脓状。精索变厚，睾丸的肿胀是继发于被动充血，极少数病例睾丸同时发生炎症。早期组织学见水肿及中性白细胞、浆细胞及淋巴细胞浸润，以后即出现脓肿。感染在后期可完全消失而无损害，但附睾管周围的纤维化可使管腔阻塞。如为双侧附睾炎，可发生男性不育症。