1、多见于泌尿生殖道感染。2、泌尿感染，男子泌尿与生殖系统的某些感染。3、使用激素或某些化学药物。4、生殖器官，精囊腺受到放射线照射，可引起精子发生突变。5、阴囊局部长期高热、长期酗酒，均可使精子发生畸变。6、内分泌功能低下，男子本身的内分泌功能低下，即体内某些相关激素的分泌不平衡，从而造成畸形率增高。
精子畸形的原因有很多，吸烟会导致精子畸形，且精子畸形的数目与吸烟时间成正比，吸烟时间越长，精子畸形的数目就越多，还有内分泌失调也会导致畸形率的上升，泌尿生殖系统感染等。畸形精子指数的正常范围是0-1.5之间的。
精子畸形率导致胎停是因为这些畸形的精子很难和受精卵结合，即使结合之后也是可能也是不正常的胚胎，所以就会引起胎儿停止发育的现象。可以去除导致精子畸形的原因，然后上医院做一下染色体分析，以便对症的治疗。
导致胎儿畸形的主要原因就是精子畸形，身体考虑是可以要孩子的，身体处于亚健康是自己考虑的，以后注意少上网，注意休息和饮食营养，身体自然会健康的，可以检查精液看精子是否正常。
精子畸形的原因有酗酒，吸烟。还有泌尿生殖系统感染，内分泌紊乱，化学制剂、环境污染以及辐射等因素，都很可能会造成精子畸形的发生。建议在日常生活中要保持一个良好健康的生活习惯，多吃新鲜蔬菜和水果，平时避免烟酒的刺激，要多运动，多锻炼。
到医院诊治找到畸形精子的原因，对症治疗，同时提高精子质量、改善精子畸形需要及时补充蛋白锌、蛋白硒、蛋白质三个物质来提高精子治疗，缩短精子液化时间、增强免疫力。食补方面多吃一些含蛋白锌、蛋白硒、蛋白质的食物，建议吃一些针对男性精子病症补充一些蛋白锌、蛋白硒，蛋白质的食品。