精子畸形的原因有很多，吸烟会导致精子畸形，且精子畸形的数目与吸烟时间成正比，吸烟时间越长，精子畸形的数目就越多，还有内分泌失调也会导致畸形率的上升，泌尿生殖系统感染等。畸形精子指数的正常范围是0-1.5之间的。
精子畸形率导致胎停是因为这些畸形的精子很难和受精卵结合，即使结合之后也是可能也是不正常的胚胎，所以就会引起胎儿停止发育的现象。可以去除导致精子畸形的原因，然后上医院做一下染色体分析，以便对症的治疗。
精子畸形的原因有酗酒，吸烟。还有泌尿生殖系统感染，内分泌紊乱，化学制剂、环境污染以及辐射等因素，都很可能会造成精子畸形的发生。建议在日常生活中要保持一个良好健康的生活习惯，多吃新鲜蔬菜和水果，平时避免烟酒的刺激，要多运动，多锻炼。
导致胎儿畸形的主要原因就是精子畸形，身体考虑是可以要孩子的，身体处于亚健康是自己考虑的，以后注意少上网，注意休息和饮食营养，身体自然会健康的，可以检查精液看精子是否正常。
泌尿生殖道感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、精索静脉曲张等，它们均可影响精子的质量，阴囊局部长期高热、长期酗酒（特别是高浓度的烈性酒），均可使精子发生畸变，使用激素或某些化学药物，如抗癌药、利血平、马利兰、呋喃类等，可使精子发育不成熟；生殖腺受到放射线照射。