药物流产也是因人而异的，到底流产会不会干净，根据怀孕的孕周、年龄，还有自己本身有没有妇科疾病都是有相关性的。在流产以后，如果看到孕囊排出来，就像白色肉一样，可看到绒毛，这种时候一般就属于药流完成。
对妊娠30天或10天以上的妇女，由于这时检查彩超都不一定能确诊宫内孕，因此，一般不宜那么早的药流发生。
如妇女此时被迫药流，容易发生药流不洁，但是有些妇女还会因为宫腔内孕囊过小而怀孕，故药流后尤为敏感，能彻底流净。所以药流完了之后是不是就彻底流净了，那就要药流1周后复查彩超，看宫腔内有没有残留的组织淤积。若复查彩超，宫腔无残留组织，那代表药流得很干净。但若药流之后继续恶露不尽，彩超再次显示宫腔内出现杂乱回声，这代表药流不全。
之所以会出现药流不干净，那是因为胚胎在子宫内一般生长的比较稳定，药流的目的是通过药物将子宫压缩，从而让胚胎排出来。尤其是在怀孕时间长了的情况下更是如此。而一旦出现药流不干净的情况时，应当立即到医院进行处理。
药物流产适合怀孕时间不超过7周内的早孕流产，正确的使用，一般都可以顺利流产。个别流产过程中，可能有流产不全的情况，少量的残留物可以通过活血化瘀的药物进行治疗，促进残留物排出，如果残留物较大的，也可以进行清宫手术。
需要尽快到医院做清宫手术，也就是将残余的妊娠物用手术方法排干净，如果药流还没有流干净，做清宫手术等于是对子宫造成了二次伤害，甚至影响女性以后的生育能力。
药流不干净后清宫是会疼痛的：
无论是人工流产的刮宫还是药流的清宫都是挺疼的，因为要用负压吸宫去吸子宫腔里的东西，但现在有无痛技术，当药流流不干净而做清宫时，也可以在静脉全麻下做清宫，这样能减少疼痛。
日常生活中，建议清宫后的女性注意保暖，不要吹冷风、碰凉水，并且注意保持外阴部清洁卫生，每天用温开水清洗1-2次以防止感染。