引起卵巢囊肿的原因主要以下几个因素：遗传因素，20%～25%有家族史；内分泌因素，临床上很多基本病理生理改变是卵巢产生过多雄激素，而雄激素的过量产生是由于体内多种内分泌系统功能异常协同作用的结果；此外还有生活方式因素以及环境因素。
多囊变成卵巢囊肿是由于丘脑下部垂体卵巢轴功能失调，破坏了相互之间的依赖与调节，因而卵巢长期不能排卵。卵巢多囊样改变是卵巢囊肿的情况，是需要根据囊肿大小，确定下治疗方法的，小于5公分，是可以保守药物进行治疗下的。
引起多囊卵巢原因目前不明确，认为它是一种卵巢增大并含有很多充满液体的小囊雄激素水平增高、不能排卵的内分泌疾病。最显著的特征是无排卵。囊卵巢的发生与月经调节机制失调有关。会出现肥胖、不孕、月经失调。建议一旦确诊为多囊卵巢，需要及时到正规专科医院进行治疗。
多囊卵巢综合征，首先就应该调整生活方式，应该控制饮食，增加运动，减轻体重。其次就是药物治疗了，可以周期性的口服短效避孕药，减少雄激素的产生，抑制子宫内膜的过度增生，抑制毛发生长，治疗痤疮，调节月经周期；对于有生育要求的女性，可以使用氯米芬等药物来诱发排卵。最后就是手术治疗。建议及时就诊，在医师指导下，选择治疗方案。
多囊卵巢囊肿可以手术治疗，如果囊肿比较小而且是良性的，一般不需要治疗也可以的，如果囊肿较大就可以手术，同时也要注意术后的保养，保持外阴清洁预防感染，少吃辛辣刺激性食物。