区别在于出检率，早期唐筛主要是颈后透明带筛查和血液筛查，两者检出唐筛的概率分别为75%和60%，可达到90%的检出率。而中期唐筛主要是血液筛查，包括人绒毛膜促性腺激素、甲胎蛋白等，二联和四连的检出率在60%到70%左右。
唐氏筛查无论是早期和中期筛查都属于比较初步的筛查，准确率都是不高的，只能是筛查出胎儿的唐氏儿的高危性，如果想要确定是不是唐氏儿都需要进一步做羊膜穿刺等检查方法。
早期唐氏筛查和中期的唐氏筛查是有区别的，早期的唐氏筛查应该是怀孕11-14周之间进行，通过检查HCG以及妊娠相关的血红蛋白，来判断胎儿是否有21-三体综合征，这一项检查主要是通过结合早期胎儿的颈项透明层的检查结果来综合进行风险评估。中期的唐氏筛查应该是在怀孕15-20周的时候进行，与早期唐氏筛查不同的是，主要是通过孕妇体内的HCG、甲型胎儿蛋白来综合判断胎儿的基因是否有21-三体综合征。
早期唐筛主要是颈后透明带筛查和血液筛查，两者检出唐筛的概率分别为75%和60%，通常可以将两者联合起来筛查，可达到90%的检出率。而中期唐筛主要是血液筛查，包括人绒毛膜促性腺激素、甲胎蛋白等，二联和四连的检出率在60%到70%左右。因此早期唐筛如果是联合筛查，其准确率较中期唐筛高。
早期唐氏筛查和中期的唐氏筛查是有区别的，早期的唐氏筛查应该是怀孕11-14周之间进行，这种检测方式需要空腹抽血，通过检查HCG以及妊娠相关的血红蛋白，来判断胎儿是否有21-三体综合征。中期的唐氏筛查应该是在怀孕15-20周的时候进行，这也是需要空腹检查，与早期唐氏筛查不同的是，主要是通过孕妇体内的HCG、甲型胎儿蛋白来综合判断胎儿的基因是否有21-三体综合征。
唐氏筛查中期一般是十四到十八周做。
唐氏筛查是针对唐氏综合症的一种早期诊断方法，孕期唐氏筛查的时间通常在14-18周左右。不管是早还是晚，都可能会对检查的准确度产生一定的影响。此外，如果检查结果为低风险，说明唐氏综合症的发病几率比较小，如果唐氏筛查有问题，可以做无创DNA，明确诊断。如果确诊为唐氏综合症，可能需要终止妊娠。