精子畸形的原因很多，有先天性的，也有附睾炎、前列腺炎、精索静脉曲张导致的，还有酗酒、吸烟会导致精子畸形，泌尿生殖系统感染也是导致畸形的一个重要原因，可以到医院生殖科或是男性科就诊，查明自身原因后针对性治疗。
吸烟时间越长，精子畸形的数目就会越来越多。如果是身体内有的相关激素的分泌不调，就会导致畸形率的上升。由于存在泌尿生殖感染疾病，精液中的营养物质就会大大的减少，导致精子发生畸形或是直接死亡。
精子畸形是可以治好的，可以吃补肾壮阳，益肾填精的药物，还需要补充天然的维生素，多补充锌，蛋白质等，饮食应该清淡，忌辛辣。就可以改善精子质量的问题。注意休息，规律睡眠，不要紧张，放松心情。
导致精子畸形的原因最常见的是不健康生活方式，比如抽烟、喝酒、经常在电脑、手机前玩或者饮食不健康，吃垃圾食品过多、熬夜等。再就是周围环境或者空气的污染，水和饮食不健康的污染，这些都可以导致精子的畸形高。身体的微量元素缺乏，可以导致精子畸形。
多见于泌尿生殖道感染（如：支原体、衣原体、淋菌、G+球菌、G-杆菌等）、先天性睾丸发育不全、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、慢性中毒、营养不良、精神过度紧张、性交过频、精索静脉曲张等以上疾病均可影响精子的发生过程。