多见于泌尿生殖道感染（如：支原体、衣原体、淋菌、G+球菌、G-杆菌等）、先天性睾丸发育不全、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、慢性中毒、营养不良、精神过度紧张、性交过频、精索静脉曲张等以上疾病均可影响精子的发生过程。
吸烟时间越长，精子畸形的数目就会越来越多。如果是身体内有的相关激素的分泌不调，就会导致畸形率的上升。由于存在泌尿生殖感染疾病，精液中的营养物质就会大大的减少，导致精子发生畸形或是直接死亡。
导致精子畸形率高的原因很多，酗酒、吸烟会导致精子畸形，泌尿生殖系统感染，是造成精子畸形的一个主要的原因，内分泌紊乱，化学制剂、环境污染以及辐射等因素，都很可能会造成精子畸形的发生。
精子畸形会一般会引发不孕不育。精子畸形一般表现为出现性功能障碍，引起全身不适：出现倦怠乏力、纳食不香、腹胀闷等，时而出现腰膝酸软等症，或伴有精索静脉曲张可有睾丸坠胀表现等。
精子畸形是可以治好的，可以吃补肾壮阳，益肾填精的药物，还需要补充天然的维生素，多补充锌，蛋白质等，饮食应该清淡，忌辛辣。就可以改善精子质量的问题。注意休息，规律睡眠，不要紧张，放松心情。
局部症状，部分患者会出现性功能障碍等。引起全身不适:出现倦怠乏力、纳食不香、腹胀闷等，时而出现腰膝酸软等症，或伴有精索静脉曲张可有睾丸坠胀表现。畸形精子是指头、体、尾的形态变异，头部畸形有巨大头、无定形、双头等。