造成精子畸形的原因有：泌尿生殖道感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、精索静脉曲张等可导致畸形精子增加，典型的是双头精子。使用激素或某些化学药物，如抗癌药、利血平、马利兰、呋喃类等，可使精子不成熟。一些急性疾病及物理、精神作用也可致精子发生畸变。
精子畸形的原因有很多，比如一些泌尿生殖系统感染，当发生泌尿生殖器的感染的时候，精液中的营养成分会减少，会使得精子发生畸形或者死亡。体内某些激素水平分泌不平衡，也有可能会导致畸形率增高。吸烟是一种不健康的习惯，同样会导致畸形精子发生率增高。酗酒也会造成精子畸形同时还可以造成性欲冷漠，阳痿早泄等性功能方面的障碍。
精子畸形的原因主要是泌尿生殖系统的疾病，比如尿路感染，精索静脉曲张，睾丸炎等，这些病因只要能够得到很好的治疗，精子畸形的情况就能够得到恢复，形成正常的精子，精子畸形、长期吸烟、饮酒、接触有害物质所致。
容易精子畸形的原因包括，不良生活习惯，如吸烟，饮酒等，环境因素，工作或生活环境有辐射，污染，或过多接触化学原料；疾病因素，如附睾炎或精索静脉曲张，导致代谢废物损伤睾丸，温度因素，睾丸长时间处于高温环境，如久坐，开等，易导致精子畸形。
正常成年男性的精液中，也存在着一些异常的精子，所占比例低于30%，多不会引起生理和生育功能。如果畸形精子率超过50%以上，则称为高畸形率和导致不孕不育症的发生。临床上多见于睾丸炎或附睾炎所引起的症状。患有精子畸形率高于50%的患者应去医院男科做详细的检查后进行治疗。
引起男性精子畸形的原因有很多，生活不规律，经常熬夜，抽烟喝酒，工作环境有污染等都会导致精子发生畸形。如果出现精子畸形要及时去治，以免导致怀孕以后导致胎儿宫内停育或者胎儿发生畸形。