男性出现生殖真菌感染，建议先到皮肤科就诊，通过真菌检查明确诊断，再通过药物和日常防范等方法进行治疗。
治疗的常用药物有伊曲康唑胶囊、复方酮康唑乳膏等药物搭配治疗，患者在日常生活中要注意私处的卫生，勤换内裤。包皮过长的患者，建议做包皮的环切术来防止复发，此外，性伴侣需要供同治疗。
生殖部位真菌感染可以通过生活护理、药物治疗等方式改善。
1、生活护理：日常的时候要注意个人清洁，经常更换内衣，日晒雨淋等，能有效的杀死细菌。
2、药物治疗：使用小苏打水冲洗，可以去除白斑和丝状的分泌物，清洁后要注意保持干燥。若确诊为霉菌，可选用抗菌药，如酮康唑，或阴道栓剂。病情较重的患者可以选择服用伊曲康唑胶囊。
对于女性生殖系统的霉菌感染，可以通过药物来进行治疗，不管是局部用药还是全身用药，都要看病情的严重程度。
如果生殖器炎是由霉菌引起的，可以通过外用抗菌药物进行治疗，在有性行为的患者最好是使用阴道用药，在治疗过程中要尽量不要发生性关系，防止发生交叉感染。
一般情况下，脸部真菌感染的治疗方法有以下几方面：
患者可以先口服伊曲康唑胶囊，但需遵医嘱，用药前辅查肝功、血脂等，也可口服盐酸莫西沙星片、复方甘草酸苷片等，再用复方黄柏洗剂、晟露洗剂等冷湿敷贴，也可以用盐酸布替萘芬搽剂、盐酸特比萘芬乳膏等交替早、晚外涂。如感染较重，需预先进行皮肤无菌清创，再用碘化钾溶液、硝酸咪康唑软膏等交替早外涂，平时应忌辛辣、忌饮酒等。
皮下真菌病和全身性真菌病统称为深层真菌病。我国深部真菌病的发生率急剧上升，这与广谱抗生素、类固醇、免疫抑制剂、器官移植、导管手术、糖尿病、爱滋病等因素有关。可通过如下方式治疗：
1.临床上以念珠菌、隐球菌、曲霉菌等最多，治疗深部真菌性疾病首先要消除各种诱发因素；
2.其次要根据患者的具体情况选择不同的抗菌药物：两性霉素B是目前常用的治疗药物。
3.氟胞嘧啶、制霉菌素；咪康唑、酮康唑、克霉唑、氟康唑、伊曲康唑等药物都可用于治疗该疾病。
耳朵内有霉菌感染时，会感到奇痒难耐。在治疗的时候患者要注意保持耳朵的干净，避免潮湿，可以在耳朵里面滴入硼酸溶液，这样可以起到收敛和抑制渗出的效果。可以外用复方酮康唑乳膏，具有抗真菌的功效。
建议患者不能频繁的抠耳朵，也不能进行摘耳手术，以免造成交叉感染。不能随便买滴耳液，否则会影响到外耳道的正常细菌环境。真菌性外耳道炎首先要确定自身的免疫系统疾病和糖尿病，要及时治疗才能缓解。