女性衣原体感染可能有尿频、尿急、尿痛等症状。
如果是尿频、尿急、尿痛、尿道口或阴道口的发红色、阴道分泌增多、发黄或粘稠的分泌物、有臭味或脓性分泌物等。在反复感染后，检查衣原体和支原体培养结果显示，只有很少一部分女性会出现不育症状。如果出现了衣原体，需要进行及时的治疗，未痊愈前不能同房，避免出现交叉感染或者是复发。
女性衣原体感染有微的瘙痒和刺痛症状。
绝大部分的病人在感染后没有明显的不适，只有很少的病人会出现轻微的瘙痒和刺痛。衣原体在呼吸道中的症状与支原体肺炎类似，症状较轻，发热，寒战，非胸膜炎症性胸痛，头痛和疲倦。咽喉痛、吞咽困难、声音嘶哑是咽喉炎症的主要症状。如果是尿路上的衣原体感染，会有尿路上的不适，比如会有溢尿，会有尿液从尿路中排出来，导致尿路阻塞，导致排尿不顺畅或者是排尿困难。
女性衣原体感染可能会出现咳嗽、咳痰、灼烧痛等症状。
衣原体有很多种，如衣原体，肺炎衣原体，鹦鹉热衣原体等。女性感染了沙眼衣原体，可能会出现沙眼、眼部炎症、咳嗽、呼吸异常、性病淋巴肉芽肿（会阴部、肝门、直肠炎症）等症状。肺炎衣原体还可引起呼吸道感染，如咳嗽、咽痛、发热等。
女性衣原体感染可能会出现阴道分泌物增多、腥臭、恶心、呕吐、排尿困难等症状。
少数情况下还可能会出现下腹疼痛、反跳痛等情况，甚至会导致不孕、流产等。如果患者出现衣原体感染，可以口服罗红霉素片、克拉霉素分散片等大环内酯类药物治疗。
用药期间主要个人卫生，勤洗澡。
衣原体感染后，女性患者主要表现为尿道炎和（或）生殖道衣原体感染。
衣原体尿道炎的致病菌以沙眼衣原体为主，是一种非淋球菌性尿道炎，临床上可见尿频、尿急、尿痛、排尿困难等症状。
生殖道衣原体感染，以外阴和阴道瘙痒为主症，阴道有不正常分泌物和气味、下腹部不舒服等，严重的会导致女性盆腔炎、输卵管炎等疾病。
女性衣原体感染症状范围更广，既能显示沙眼、泌尿系统感染等，还可呈现肺炎样的症状，比如咳嗽和咳痰等、生殖道发痒，灼烧痛的症状。
衣原体有很多种，包括沙眼衣原体等、肺炎衣原体，鹦鹉热衣原体和其他。女性感染衣原体后，可能会出现眼部炎症、尿道灼烧感、瘙痒感、咳嗽、呼吸异常等症状。