非淋菌性尿道炎患者可以选择消炎药、抗生素类药物进行治疗。
非淋菌性尿道炎用药通常以红霉素类为主，如阿奇霉素片罗红霉素分散片或红霉素肠溶片之类。通常也有可与盐酸环丙沙星胶囊或左氧氟沙星片合用。有些也可与盐酸米诺环素胶囊和盐酸多西环素片联合使用。
慢性非淋尿道炎患者需要遵医嘱吃药，比如阿奇霉素或米诺环素等。
沙眼衣原体、支原体等感染可能会导致沙眼衣原体、支原体等感染，这是一种泌尿生殖道的急、慢性炎症，患者可能会有尿急、尿痛等症状。建议患者及时前往正规医院，在医生指导下吃阿奇霉素或米诺环素等药物来治疗。
非淋尿道炎吃红霉素、氧氟沙星、左氧氟沙星等药。
红霉素、氧氟沙星、左氧氟沙星等都是治疗非淋菌性尿道炎的常用药物。盐酸米诺环素是临床上最常见的一种，服用后7日左右就会出现明显的改善。尿道口分泌物、尿急尿频尿痛等情况要到正规的医疗机构进行检查，确定病因，在医师的建议下进行相应的用药。
如果是非淋菌性尿道炎，可以口服一些大环内酯类的药物。阿奇霉素、红霉素、罗红霉素、多西环素、米诺环素、克拉霉素等都是比较常用的抗生素，这些都是能够杀死支原体和衣原体的，不建议大家服用头孢菌素和喹诺酮，这两种抗炎症的药，对非淋的治疗作用比较弱，并不能完全杀死支原体和衣原体。在治疗过程中要注意多饮水，注意内衣的清洗，避免出现相互感染。如果是已婚人士，建议夫妇同房，以防止反复感染。
非淋菌性尿道炎可用广谱青霉素、头孢菌素类药物等药物进行治疗，该类药物均属于一种致病菌敏感的抗生素，对该病患者具有较为有效的抗病原菌治疗，缓解患者出现的临床症状。此外，患者还可使用地塞米松，该药可配合上述抗生素药物，进行辅助治疗，同样具有抑制炎症反应的作用。
非淋尿道炎对症用药好得快。
肺淋球菌尿道炎一般是指非淋病奈瑟菌引起的尿道炎症。患者常会出现尿痛、流脓等症状。患者可患者需要对症进行治疗。若为微生物则需使用大环内酯类药物，若是病毒感染则考虑使用抗病毒药物，通常会有较好的治疗效果。
用药期间，患者需戒烟戒酒，避免损害身体健康。