通常情况下，月经结束后有褐色分泌物持续几天不严重，可以不用处理，有炎症可以使用药物进行治疗。具体情况分析：
月经结束后有褐色分泌物有生理和病理两种可能，生理性的多是由于确实还没有完全排干净，因为有的患者月经干净以后阴道会再次出血几天，并且颜色也会相对暗一些，如果不伴有肚子痛或者白带异常的情况，一般就不用处理，期间注意个人卫生即可。如果是病理性的多是由于有炎症，并且伴有身体不适，如盆腔炎、宫颈炎，患者需要做彩超和妇科内诊检查，在确定是宫颈炎的情况下，可以阴道上药消炎治疗，一般不建议单纯口服用药，因为效果不佳，在确定是盆腔炎的情况下，还可以口服药物进行治疗。
月经结束以后有褐色分泌物可能是节育环、黄体萎缩不全等原因引起的，需要根据实际情况进行治疗。因为上环以后也容易出现褐色分泌物。这种情况多见于刚刚上环以后，这种情况下可以遵医嘱应用妇科止血灵、安络血等药物进行调理，通常半年以后就会适应。另外，黄体萎缩不全也容易出现月经结束以后有褐色分泌物的情况，患者可以在月经的后半期遵医嘱应用黄体酮进行治疗，同时注意保持外阴清洁、干燥，避免出现感染的情况，还要注意尽量不要熬夜。
月经结束后有褐色分泌物的原因较多，常见的有以下几种。
来例假后如果出现棕色的分泌物，可能是因为经期没有排完。黄褐分泌物主要是由于子宫有炎症或是药物流产引起的，其次是由于精神过度的压力，内分泌紊乱。可以去正规的医院进行激素六项和B超的诊断，明确原因后再进行治疗。日常生活中要注意个人的局部卫生，要穿着干净的棉质宽松的内衣。还要做好自己的身体，防止感冒。
一般情况下，月经结束后有褐色分泌物可能是月经未干净、内分泌失调等原因引起的。
月经结束后有褐色分泌物主要是月经没有完全干净引起的，如果女性体内的激素水平变化，还可能引起内分泌紊乱，从而到孩子月经结束后有褐色分泌物，一般表现为月经淋漓不断、有黑色的分泌物，部分女性可能会出现腰酸、腰痛等症状。如果这个阶段女性没有注意清洁卫生，可能会发生感染。这种情况建议女性保持阴部清洁、干爽，避免吃刺激性的食物，并进行性激素六项进行检查体内的激素水平，然后服用药物来调节激素水平，同时要服用宫血宁胶囊来凉血、止血。
一般情况下，月经过后有褐色分泌物可能是月经未干净导致的，这时少量的经血与白带混合而呈现褐色，一般几天后会自行消失，不必做特殊处理；如果褐色分泌物一直存在，则可能是妇科疾病导致的，如子宫内膜炎、宫颈炎等，女性一般需要进行抗炎治疗。女性可以在医生指导下服用阿莫西林片、甲硝唑片等药物进行治疗。此外，日常生活中要注意饮食清淡、少吃刺激性的食物。
月经结束后有异味，多见于妇科炎症，可以看医生做白带常规检查，这样可以确定炎症的类型，或者说是什么原因导致的炎症，然后给予相应治疗措施，一般以局部使用药物治疗为主，治疗期间需要避免性生活。如果检查发现属于非特异性阴道炎，可以使用甲硝唑阴道泡腾片，也可以在医生指导下使用1∶5000浓度左右的高锰酸钾溶液外洗，也可以改善症状。