甲状腺过氧化物酶>1000IU/ml，不一定需要治疗，主要取决于患者甲状腺功能是否受到影响。
即使甲状腺过氧化物酶水平明显升高，只要患者甲状腺功能正常，一般无需药物治疗。在饮食上，可以减少海带、紫菜等富含碘的食物，多吃富含硒元素的食物、粗粮、蘑菇、菌类等。患者甲状腺过氧化物酶抗体明显升高，也出现甲状腺功能减退症等甲状腺功能异常时，对抗体水平升高不需要用药，对甲状腺功能减退症使用左甲状腺激素钠，替代治疗即可。甲状腺过氧化物酶抗体是甲状腺的自身抗体，易引起桥本甲状腺炎，部分患者可发生甲状腺功能减退症。
甲状腺过氧化酶抗体大于1000确实是明显偏高，如果仅限于抗体偏高，没有什么特殊意义。所以说定期复查就可以，每年复查1次甲功及甲状腺抗体。也可以加查一下甲状腺彩超，观察甲状腺形态是否有变化。
抗甲状腺过氧化酶抗体是甲状腺功能化验结果中的一项，如果化验抗甲状腺过氧化酶抗体偏高需要结合甲功以明确现有的病情，发现甲状腺肿大或者甲状腺功能异常的时候，都需检查甲状腺激素水平，还有甲状腺过氧化物酶抗体和甲状腺球蛋白抗体。
孕妇甲状腺过氧化物酶抗体过高应由自身免疫引起，属于自身免疫性疾病，可以考虑是桥本氏甲状腺炎。
若发生桥本氏甲状腺炎则可能表现为甲状腺功能减退，需进一步复查t3、t4含量。如结果不正常，这一现象很可能影响胎儿，甚至发生流产的情况，因此必须在医生指导下积极治疗，通常可使用优甲乐进行治疗，以免对胎儿造成伤害。
甲状腺过氧化物酶抗体过高是抗血液中抗甲状腺细胞的抗体，其水平高低完全是自身免疫的整体环境所致。
甲状腺过氧化物酶抗体高，对桥本甲状腺炎的诊断有很强的临床意义。但单纯抗体高、甲状腺激素水平正常的患者，不必过于担心。甲状腺激素水平正常，但只有单纯抗体高的患者，没有降低抗体水平的药物。只要定期随访甲状腺激素水平，只要甲状腺激素水平正常，无需特殊处理。
甲状腺过氧化物酶抗体高时，一般临床诊断为自身免疫性甲状腺疾病，其治疗可根据T3、T4、TSH结果分为以下几种情况：
1、甲功正常，T3、T4、TSH均在正常范围，甲状腺过氧化物酶抗体高时，只需低碘饮食，不吃含碘较高的海带、紫菜，其余海鲜、碘盐均可正常使用。
2、若甲功异常，T3、T4、TSH不在正常范围，建议去内分泌科就诊，需详细检查后对症治疗。