甲状腺过氧化物酶抗体高时，一般临床诊断为自身免疫性甲状腺疾病，其治疗可根据T3、T4、TSH结果分为以下几种情况：
1、甲功正常，T3、T4、TSH均在正常范围，甲状腺过氧化物酶抗体高时，只需低碘饮食，不吃含碘较高的海带、紫菜，其余海鲜、碘盐均可正常使用。
2、若甲功异常，T3、T4、TSH不在正常范围，建议去内分泌科就诊，需详细检查后对症治疗。
抗甲状腺过氧化物酶抗体为自身免疫损伤的标志物，也是诊断甲状腺自身免疫性疾病的首选指标。若其有所增高，则代表着体内存在自身免疫的破坏。若在升高的同时，出现促甲状腺素下降，血清游离T3、T4升高，表示合并甲亢，此时应接受抗甲亢药物治疗。
促甲状腺过氧化物酶抗体高需要及时口服免疫抑制剂和激素药物治疗。甲状腺过氧化物酶抗体就是血液中一种对抗甲状腺细胞的抗体，其水平的高低完全是由于自身免疫的整体环境所造成的。
抗甲状腺过氧化物酶抗体是一种与甲状腺疾病有关的自身免疫性抗体。
这种抗体升高，提示孕妇可能患有原发性甲状腺功能减退。对于孕妇来说，抗甲状腺过氧化物酶抗体升高是比较重要的异常检查结果。妊娠期出现这个抗体升高，提示可能患有妊娠期甲减。妊娠期甲减会影响孩子正常发育，有可能导致宝宝的体格发育缓慢，智力发育障碍，需要进行进一步的检查，明确诊断。确诊是妊娠期甲状腺功能减低，就需要遵医嘱服用甲状腺素片进行替代治疗。
抗体异常升高，可以诊断为自身免疫性甲状腺疾病，对于这类孕妇人群需要对甲状腺功能，进行更加密切的监测，很容易出现甲减，一旦出现甲功减退，则需要及时补充甲状腺激素替代治疗。
甲状腺激素水平正常，而单纯只是抗体高的患者，并没有一种药物可以用来降低抗体水平的。只要定期的随访甲状腺激素水平，如果其甲状腺激素水平是正常的，不需要特殊处理。