甲肝打疫苗是自费，甲肝疫苗不属于国家计划内的疫苗，是收费的，乙肝疫苗属于计划内的免疫，是免费的，乙肝疫苗属于一类疫苗，属于免费接种的，甲肝疫苗属于二类疫苗，是收费。
接种此疫苗后可能出现的不良反应有，发热，接种部位疼痛、硬结，厌食，恶心、呕吐，皮肤瘙痒等，在3天左右可以自然缓解。还有少部分接种者可以出现较为严重的不良反应，比如过敏性休克，应该尽快给予脱敏及抗休克治疗。
甲肝疫苗是用于预防甲型肝炎病毒传染而使用的疫苗。分为减毒活疫苗和灭活疫苗，在免疫效果、安全性上，灭活疫苗优于减毒活疫苗。甲肝减毒活疫苗是免费的，属于一类疫苗。甲肝灭活疫苗不属于一类疫苗，在不同的地区收费有所差别，部分地区是自费的。甲肝灭活疫苗要进行两次的注射，才可以产生有效的免疫效果。无论是自费还是免费，都属于国家批签发的合格疫苗。
甲肝和乙肝都是传染性较强的疾病，其严重程度无法直接比较。
甲肝和乙肝有其自身的不同之处，甲肝属于急性肝炎，通过消化道传播，大部分肝功能受损不严重，患者需要多休息，同时服用保肝降酶的药物。乙肝有两种，一种是急性乙肝，一种是慢性乙肝，90%以上的急性乙肝可以自行治愈，而慢性乙肝则需要长期治疗，有些人甚至终身服用药物，同时还要定期监测肝功能、乙肝DNA、肝脏彩超等相关指标。由于具体病情不同，并不能简单地说甲肝或乙肝哪个更严重，平时都需要引起重视，避免被传染。
免费的属于计划免疫，是国家规定的免疫项目之一，可以无偿的免费给需要接种的小儿注射。可以优先考虑免费疫苗，对于收费疫苗，属于二类疫苗，管理一般也是比较严格的，有些属于进口疫苗，如果经济条件相对比较好，也可以考虑用进口疫苗，费用相对比较高。
甲肝和丙肝中，一般丙肝严重。
实际上甲肝为急性自限性肝病，多在4~8周后自然痊愈，或护肝、降酶之类的治疗，均能彻底痊愈，不留后遗症。甚至病情轻的，无需处理，只需经过充分睡眠即可，合理进食还能彻底痊愈。对于乙型肝炎来说，是一个非常常见的传染性疾病，在很多人看来，只要有了感染，就可以传播给其他人群。但丙型肝炎不同，丙型肝炎中绝大多数为慢性丙型肝炎。一旦出现了肝炎的话，在短时间内还无法恢复，并且有可能还会持续发展。如不治疗，不处置，易发展成肝硬化或肝纤维化，还可明显增加肝脏肿瘤发生的危险。因此，对于丙肝患者来说，一定要做好充分的准备工作。但目前丙肝还能完全根治，可选用某些抗丙肝病毒新药物治疗，必须从实际出发。