夜间酵素副作用是过敏反应，少部分人进食后，会引起皮疹、瘙痒、出汗、腹痛等不良反应，因此对酵素过敏者应该禁用。糖尿病病人应该慎用。容易引起胃部不舒适的感觉，酵素属于弱酸性的物质。
通常情况下，夜间酵素具有一定的减肥作用。
夜间酵素里含有大量的生物活性酶和多种微量元素，可以在一定程度上加快胃肠的蠕动，促进身体的新陈代谢，排出体内的垃圾，而且还可以帮助身体提高脂肪的分解率，同时可以提高睡眠质量，所以夜间酵素具有一定的减肥作用。但是减肥需要保持营养均衡，多吃营养丰富的食物；适当进行运动，不能长期通过夜间酵素减肥，不利于健康，并且体重容易反弹。
可以加速人体的代谢和吸收，清理体内所堆积的垃圾，净化体内环境。最大的功效就是清理肠道毒素，通便排毒及净化血液，正常用于身体堆积过多毒素导致的肥胖有很好的效果。便秘、亚健康、生活不规律等都可以服用医食同源夜间酵素，服用该酵素可以增强免疫力、抵抗亚健康、有助于睡眠、改善肠道环境、帮助消化的作用。
夜间酵素应该是不能用于减肥的，如果想要减肥，可以通过锻炼和控制饮食的方法来达到减肥的目的。酵素就是蛋白质的一种，在消化道中会被分解，没有机会进入细胞，不可能起到宣传中的减肥作用。至于酵素的其他功效，目前也并无任何科学依据。
桑葚酵素对糖尿病的效果非常好。
桑葚酵素适合2型糖尿病患者、肾功能减退导致下肢水肿者食用，桑葚酵素不仅有利尿的作用，还具有加强胰腺代谢和保护胰腺功能的作用。因为桑葚酵素发酵中糖会变成低聚糖，所以糖尿病患者可以放心食用。糖尿病患者可以每天中午饭前30分钟食用、水肿者每天早上喝空腹服用，可以防止血管硬化。桑椹含有脂肪酸，主要由亚油酸、硬脂酸及油酸组成，具有分解脂肪、降低血脂、防止血管硬化等作用。
