绿激光前列腺手术的缺点是绿激光穿透的深度浅，使得前列腺组织汽化，费的时间比较长，前列腺增生组织去除就不够彻底，表面不平滑。因此通常近期效果还可以，但是远期效果就不满意，还有就是绿激光前列腺手术会把前列腺组织都汽化掉了，所以无法收集标本做病检。
绿激光前列腺手术最大的缺点就是组织气化掉，没有取到合理的前列腺组织标本，手术后没有标本进行病理学分析，对与否有前列腺癌就没有办法进行有效的诊断和鉴别诊断。
一般在两万元内，绿激光治疗前列腺手术费用并不是固定的，会受到病情、医院、地域等因素的影响。采用绿激光治疗慢性前列腺炎要符合适应症，一般主要是存在明显的排尿困难、并发症，或者是保守治疗的效果不佳，才考虑采用该手术。
绿激光手术最大的缺点就是它是将组织气化掉，不能取到组织标本，对于前列腺增生来说，如果没有足够的标本，不能有效的检测，是否有前列腺癌的可能性存在，对于很多前列腺增生的病人手术后出现前列腺癌性病变，这就是绿激光手术的最大的缺点。
前列腺增生是可以采用绿激光水书继续治疗的，前列腺增生是一种常见的男性疾病，主要的危害就是阳痿，排尿困难，精液的异常，前列腺增生或发生炎症，会使精子的质量和活动度，性欲都会下降。
