绿激光手术最大的缺点就是它是将组织气化掉，不能取到组织标本，对于前列腺增生来说，如果没有足够的标本，不能有效的检测，是否有前列腺癌的可能性存在，对于很多前列腺增生的病人手术后出现前列腺癌性病变，这就是绿激光手术的最大的缺点。
绿激光前列腺手术的缺点是绿激光穿透的深度浅，使得前列腺组织汽化，费的时间比较长，前列腺增生组织去除就不够彻底，表面不平滑。因此通常近期效果还可以，但是远期效果就不满意，还有就是绿激光前列腺手术会把前列腺组织都汽化掉了，所以无法收集标本做病检。
绿激光前列腺手术最大的缺点就是组织气化掉，没有取到合理的前列腺组织标本，手术后没有标本进行病理学分析，对与否有前列腺癌就没有办法进行有效的诊断和鉴别诊断。
钬激光前列腺手术缺点是支架管的尾端靠近膀胱颈部和尿道，可能会引起不同程度的尿频、尿急或者尿痛。排尿时膀胱内尿液逆流入肾脏，可能引起不同程度的腰痛。支架管与输尿管及膀胱摩擦，可能引起轻度血尿，尿色呈现类似西瓜汁或洗肉水的淡红色。
前列腺手术后尿失禁可能是多种原因导致的，具体分析如下：
这可能是因为尿道感染、手术时对括约肌造成的损伤等原因导致的。尿流动力学、尿常规、尿培养、尿流动力学等都可以确诊，如果是尿路感染导致的，可以服用呋喃妥因片，磺胺嘧啶片等抗炎的药物，通过积极的控制炎症感染可以改善尿失禁，如果是因为括约肌损伤导致的尿失禁，可以通过人工括约肌进行手术。
慢性前列腺炎应尽量减少性交次数，使前列腺得以充分休息，减少充血，促进炎症的早日痊愈，若不注意节欲。则好比火上浇油，造成恶性循环，而且还会使性功能障碍的症状更加严重。因此，慢性前列腺炎的饮食治疗宜选用具有补气益肾、营养丰富的食物，避免刺激性食物，如酒、辣椒、葱、蒜、姜、咖啡等，以免引起前列腺充血，使病情反复。温热和油腻食物也不宜食用。