如果是在乙肝病毒DNA转阴性之后，患者一般不能擅自停药，以免影响病情的控制。
目前对乙肝的抗病毒治疗主要是采用高效力、低耐药性的抗病毒药物，大多数病人服用3-6个月之后，会发现HBVDNA会发生转阴性，但是如果停药，可能会引起HBV的再次发作，也有少部分病人会有严重的肝炎症状，在医生的建议下进行治疗和停药。目前慢性乙型肝炎可以服用4年或更多的抗病毒药物，长期服用可以降低复发，少数病人推荐终生服用。
不一定，乙肝病毒携带者，说明感染了乙肝病毒，目前没有特效药物和方法根治慢性乙肝，不过，在对症的中医中药或西药治疗下，是可以达到肝功能正常且病毒量阴性的目标。不过，也有自然转阴的个例。
对于乙肝最主要的治疗方式就是进行抗病毒治疗，可以选择传统的治疗方案。另外就是使用口服核苷酸类的药物，部分病人可以达到表面抗原的清除，也就是临床治好的效果，但是临床治好率是比较低的。
在部分乙肝携带者中，如乙肝表面抗原极低，病毒低于检测下线，随着年份的增加看，有自发转阴的情况，也有经过干扰素治疗后转阴的。肝携带者需定期复查腹部彩超、乙肝DNA、乙肝五项、肝功能、甲胎蛋白，需注意休息，勿熬夜、劳累、饮酒等。如肝功能反复异常，则可能要抗病毒。
乙肝病毒携带者很难自愈，也就是说很难清除自身携带的病毒因。因为机体对病毒的感染处于免疫耐受状态，不和病毒发生斗争，不识别病毒，所以可能一直是这种携带状态。当然也有大约1%-3%的患者可以自发的清除病毒。
乙肝病毒携带者，是指感染了乙肝病毒，没有肝炎症状和体征，肝功能等各项检查正常，1年内连续随访3次以上，血清ALT和AST均在正常范围，肝组织学检查一般无明显异常的群体。乙肝病毒携带者，一般不需要治疗，当然，要养成良好的生活习惯，饮食习惯，不吃辛辣刺激食物，不吃油腻，戒烟酒，休息好保持心情舒畅。
