脑炎与自身的免疫系统相关，当病人自身免疫力较差时，会导致免疫缺陷性病变。
某些病菌，如细菌、病毒、霉菌等，很可能会通过人体的血液传播，进而影响到中枢神经，从而引发脑炎。也有可能是由于Hiv病毒引起的免疫系统的不足，从而引起了真菌感染，从而引起了细菌感染的脑炎，例如隐球菌感染会引起隐球菌性脑炎。这种情况下，要进行抗菌药物的治疗，并且会有一定的难度，病人的预后也会很差。
糖尿病会引起人体免疫系统疾病。
因为糖尿病是一种消耗性疾病，常伴有多食、饥饿、易瘦等症状，可能导致免疫力低下。此外，长期血糖高或波动大，也是增加感染风险、降低糖尿病患者免疫力的重要因素。随着糖尿病患者的增加，糖尿病已成为人们关注的公共卫生问题。很多患者认为血糖高一点也不可怕，但糖尿病可能合并多种并发症，如糖尿病酮症酸中毒、糖尿病高血糖高渗状态等。也有糖尿病慢性并发症，如糖尿病视网膜病变、糖尿病肾病、糖尿病神经病变等，都是导致糖尿病畸形、致死率升高的重要原因。
免疫疾病包括类风湿关节炎、成人斯蒂尔病、干燥综合征、多发性肌炎与皮肌炎、抗合成酶抗体综合征、混合性结缔组织病、硬皮病、系统性血管炎、抗磷脂综合征、纤维肌痛综合征、强直性脊柱炎以及系统性红斑狼疮等。
免疫系统疾病非常多。免疫系统具有免疫监视、防御、调控的作用，如果免疫系统这三方面功能出现了问题，就可以出现免疫系统疾病。可以出现结缔组织病，例如类风湿关节炎，系统性红斑狼疮等。
过敏是属于免疫系统疾病，这是人体的变态反应性病症。在人们出现了过敏之后，比如出现皮肤红疹、瘙痒以及呼吸困难的时候，就应该先判断过敏的严重性。要是轻微过敏，自己服用抗过敏药物即可，要是病情严重就要及时就医。而且在大家出现过敏症状时，就应该查找过敏原。
