可以进行抗寄生虫治疗，可以选用阿苯达唑，剂量需根据体重调整。用药之前可查眼底和头核磁，观察是否有病灶，避免杀死虫体时引起身体的损伤。一旦出现巨大压迫后，需要进行外科手术，完整地摘除寄生虫囊包，同时抗寄生虫治疗。如果囊包出现继发性的细菌感染，还需要使用抗菌药物。
羊脑包虫病主要是由于与动物接触密切。皮毛上的毛虫卵随风飘扬，经过呼吸道感染。要保证良好的卫生及生活环境。经过正规的治疗，是可以治好。包虫病会和动物之间传染。人与人之间并不会传染。诊断方法经临床检查羊不断地向左侧作圆圈运动，圈很大，说明虫卵体不大，用手触摸左侧顶骨骨质变薄，皮肤稍隆起，能压感到骨质变软，可行手术治疗。包虫病会传染的，日常生活中应注意饭前便后要洗手，食物要煮熟煮透。
脑包虫病是指脑包虫寄生于脑组织内，或者是脑室内，而引起的一种脑部寄生虫感染性疾病，如果病变位于大脑半球，基底节区，放射冠区，可以出现偏瘫，偏盲偏身感觉障碍。左侧病变时，也可以出现言语功能障碍。
包虫病会引起肝区隐痛，坠胀不适，上腹饱满，食欲不佳，呼吸困难还常伴有胸部隐痛或刺痛；巨大肺包虫可由于挤压支气管而引起干咳，也可由于压迫肺组织而产生胸闷气短。其他脏器如脑、肾、心等包虫病，其后果更为严重。应尽早到医院进行治疗。
肝包虫病就是包虫寄生到肝脏引起了病变在肝脏里面繁殖生存就叫肝包虫病，常见于牧区，因为包虫常寄生于牛，羊，这些农牧区养殖的地方，如果平时与这些动物接触比较多，包虫经过食物传播或者经过其他的途径传播到体内以后，包虫通过胆道系统进到了肝脏组织，在里面繁殖生存，最后引起肝脏的损害。