进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
如果有宫颈糜烂要做宫颈检查，当然首先要去做宫颈排癌检查，做tcd检查和HPV检查。如果排除了宫颈病变，一般是宫颈炎症或者是宫颈糜烂，可以先用药治疗，药物治疗效果不好，还可以采取利普刀手术治疗或者激光手术治疗。
粪便脓液-粪便脓液检查，检查方法简单，结果直观，肛门指检-肛肠疾病是临床常见的疾患。其中以痔疮、肛周脓肿、肛瘘、直肠良、恶性肿瘤居多。绝大多数的肛肠疾病可通过肛门指检作出初步诊断，而肛门指检又是极为方便的措施。
早期肛瘘通过直肠肛门指检，可以摸到条索状的一个管道、大部分通过目测和直肠肛门指诊即可检查出来，少部分复杂或难以确诊的，做腔内超声或者是肛周超声或核磁共振进行确诊，通过直肠腔内超声，能够发现直肠肛围的脓肿、管道等。
可以通过验血，通常不需要绝对禁食，任何时间段都可以检查，一般验血乙肝全套都可以。通常有五个项目。目前，有六个项目在临床实践中很常见。可以检查一整套乙型肝炎病毒来确定是否存在乙型肝炎病毒感染。乙型肝炎表面抗原阳性可用于确认乙型肝炎病毒感染。
