小儿单纯性肥胖的鉴别诊断主要是对伴有肥胖的遗传性疾病和内分泌疾病进行鉴别，遗传性疾病包括三种:
第一，Prader-Willi综合征，手脚小、身材矮小、体态肥胖、肌张力低、智力低下、外生殖器发育不良。
第二，Laurence-Moon-Biedl综合征，肥胖、多指、多趾、轻度智力低下、视网膜色素沉着、性功能降低。
第三，Alstmm综合征，失明、糖尿病、中央型肥胖、视网膜色素变性、神经性耳聋。
内分泌疾病包括肥胖生殖无能症，是由于下丘脑及垂体病变，体脂分布于磕下、颈、下肢、乳房、会阴、臀部。身材矮小，手指和脚趾纤细，第二性征延迟或没有。其他内分泌疾病有甲状腺功能降低、肾上腺皮质增生、生长激素缺乏等，都有皮质增多但均各有特点。
小儿肥胖到底花2千-3千元左右。病情严重，其治疗时间就越长、治疗方法也大不相同、预后费用也将增加，进而整体费用加大。孩子得了肥胖症，早治疗才能最大程度上节省治疗费用。
小儿单纯性肥胖的治疗方式如下：
儿童单纯肥胖的治疗方法有行为治疗、饮食治疗、运动治疗等。儿童的行为治疗主要是纠正不良的饮食习惯、运动习惯等，从而达到降低或控制体重的效果，同时也可以让父母或老师给孩子列出矫正的目标和具体的内容。在饮食治疗上，可以采取白水煮、凉拌、清蒸等烹饪方式，以低糖、低脂的食物为主。运动治疗的原则是安全，易长期坚持。
小儿单纯性肥胖症治疗可做好，减轻精神负担，增加锻炼等方面进行，任何的肥胖症都要进行饮食管理，饮食管理规则如下：
限制食量要照顾基本营养及生长需求，使体重逐渐降低，满足食欲，避免饥饿感，蛋白质食物满足食欲的作用较高，是生长发育所需，不能少于2g/kg/d。碳水化合物对代谢体内脂肪及蛋白质有帮助，可作为主食，要限制脂肪供给，减少总热能，维生素、矿物质要保证，食品以水果、蔬菜、麦食、米饭为主，加入蛋白质食物，如瘦肉、鸡蛋、鱼、豆及制品。
一般情况下，小儿肥胖症要做常规检查、血脂检查、肝脏超声等检查：
1、常规检查：常规检查包括身高、体重、视力、腰围、臀围、等，可以查出有无异常。
2、血脂检查：肥胖儿甘油三酯、胆固醇大多增高，血脂检查可以查出相关指标的水平，辅助诊断疾病。
3、肝脏超声：肝脏超声波检查可以观察有无脂肪肝，对症治疗，有助于病情的恢复。
