脑底脉管炎致管腔阻塞。引起相应部位脑缺血和梗死；脑积水：由于脑膜粘连，脑脊液循环障碍所致；颅神经受损麻痹：如耳聋、视力障碍、斜视、面神经瘫痪等。有手引起脑膜炎后遗症的原因。
完全恢复的可能很小。由于脑膜炎合并了脑组织损伤，脑细胞损伤与其他组织损伤不同，脑细胞损伤不能再生和修复，遗留的运动，感觉功能障碍，目前没有很好的治疗措施和方法。
如果脑膜炎的后遗症不是很严重，可以治疗，用一些营养神经和相关的药物。同时应该注意康复训练。如果疾病特别严重或有严重并发症，应进行手术。手术后，还可以进行一些康复训练，或者用一些药物疗法来改善症状。
和病毒的分类有关系。病毒性脑炎的预后与病变的程度和病情的严重程度有关。脑部病变更加有限，不会侵入生命中心。当病情轻微时，预后通常很好。如果昏迷持续很长时间，或者经常出现抽搐，大脑就会缺氧，病情加重，预后很差，很容易留下神经和精神后遗症。
整个身躯症状有发热、头痛、身痛、恶心、呕吐、身体没力、疲乏；系统症状有：神经意识障碍，脑膜刺激征，肢体力气不足，局灶性神经受损神经缺损症状，如面神经瘫痪，偏瘫，喉麻痹等。有的还可能引起昏迷或者癫痫发作的情况的。
