肠结核一般起病较缓，且早期症状不明显。肠结核的临床表现分为两大类。一是全身症状有潮热，盗汗，发热，乏力，营养不良，消瘦等。还有消化道症状腹痛，腹泻，便秘，大便带血等。
肠结核狭窄，腹痛可给予抗胆碱药或其他解痉药。伴有不完全性肠梗阻者，给予胃肠减压以减轻梗阻近端肠管的扩张与潜留。完全性肠梗阻，肠道大量出血经积极内科治疗仍未能满意止血者需要手术治疗。
肠结核是临床上较为常见的肺外结核病，是因结核杆菌侵犯肠道而引起的慢性感染。绝大多数继发于肠外结核，特别是开放性肺结核。发病年龄多为青壮年，女略多于男。肠结核的治疗与肺结核一样，均应强调早期、联合、适量及全程用药。
肠结核的检查主要有专科医生的病史询问、体格检查，以及一些实验室和器械辅助检查，比如血常规、红细胞沉降率、胸部的X平片这些一般检查。还有就是需要相应的比较特殊的，比如X线的钡餐或者钡剂灌肠检查、显微结肠镜检查，必要的时候可以在镜下进行活体组织的病理检查。
肠结核会出现消瘦乏力、低热盗汗等全身症状，随病程发展身体会出现维生素缺乏、营养不良、贫血等表现，腹痛可位于脐周，较轻，呈隐痛和钝痛，有的会出现间歇性疼痛，常于进餐时和餐后诱发。
