抗甲状腺药物治疗常见副作用有：
1、白细胞减少，严重患者可引起粒细胞缺乏。白细胞减少时，合并上升药物口服，定期复查血常规。发展为粒细胞缺乏，需停止抗甲状腺药物治疗，给予促进白细胞生成的药物。
2、肝功能损害、抗甲状腺药物可引起中毒性肝病，其中丙硫氧嘧啶最易导致丙转氨酶或谷丙转氨酶水平升高。给予抗甲状腺药物后，定期复查肝功能，必要时停用抗甲状腺药物，用保肝药物治疗。
3、出现皮疹后进行抗过敏药物治疗。皮疹严重时，可停止抗甲状腺药物治疗。患者口服抗甲状腺药物治疗出现严重不良反应，应考虑更换碘-131治疗或外科手术治疗。
甲状腺药物有抗甲状腺功能亢进症药物和甲状腺功能减退症治疗药物，抗甲状腺功能亢进症药物临床上主要有两种：甲泼尼龙和丙硫氧嘧啶。这两种药物最常见的不良反应是：
1、白细胞和粒细胞减少；
2、肝功能损害；
3、可出现皮疹、皮肤瘙痒、荨麻疹等；
4.出现罕见肌肉酸痛、血管炎等。所以在服用这类药物的过程中，要定期复查肝功能和血常规。治疗甲减的药物有左甲状腺激素钠，剂量增长过快或剂量过多可引起心悸、出汗等不适症状，长期大量使用可引起骨质疏松。
硫脲类药物引起的甲亢不良反应包括皮疹、皮肤瘙痒、白细胞减少症、粒细胞减少症、中毒性肝病和血管炎等。
甲环唑的不良反应是剂量依赖性的，而丙硫氧嘧啶的不良反应是非剂量依赖性的，两药交叉反应的发生率为50%。白细胞减少，白细胞低于4.0，中性粒细胞超过1.5，一般不需要停药，可减少抗甲状腺药物剂量，一般给予增白药物。甲状腺功能亢进症在病情不受控制时也可出现白细胞减少，用药前后需比较白细胞数量。皮疹和瘙痒的发生率约为10%，可采用抗过敏药物纠正，皮疹严重必须停药，避免发生剥脱性皮炎时，可改用同位素治疗。患者有关节痛时必须停药。否则，可能发生抗甲状腺药物引起的关节炎综合征。
抗癫痫药物的副作用有胃肠道的不适，如恶心、呕吐，可出现头晕、头疼、嗜睡、视物双影、肢体活动的共济失调。抗癫药物的副作用还可以表现为血细胞的异常，如白细胞减少或血小板减少；还可以引起肝功能的损伤。
服用荨麻疹药物是具有一定副作用的，病人可能会出现轻度嗜睡，口干等副作用。如果长期用药，很可能会造成胃肠不适。如果身体出现了荨麻疹，建议到当地医院就诊，并遵医嘱服用药物，将对身体的伤害降到最小。
抗结核类的药物，一般副作用会出现肝损伤，肾损伤，关节痛，转氨酶升高，黄疸升高，头晕嗜睡，头痛乏力，周身不适，视力减退，甲状腺肿大过敏等症状。有很多也会出现胃肠道反应，比如恶心，呕吐，腹胀，腹痛等症状。
