支原体、衣原体等是轻度或中度的，自身的免疫功能是可以自行恢复的。支原体、衣原体感染、自身免疫力低下等情况，是很难治愈的。
对于支原体、衣原体的治疗，可以选择红霉素、阿奇霉素、罗红霉素等三种药物。近年来，对支原体的抗药性越来越强。抗药性高达75%，使用红霉素类的药物也不一定有效。如果治疗无效，可以选择环丙沙星、左氧氟沙星等喹诺酮类药物。另外，四环素、多西环素、米诺环素等都是四环素。
支原体衣原体感染的严重程度，取决于它所引起的何种结果。
第一，造成不适，如支原体，衣原体尿道感染等，会引起尿痛或者尿道刺痛。支原体衣原体感染前列腺，就是前列腺炎，会导致尿频，尿急等不舒服。支原体衣原体感染精囊或生殖系统，会造成受孕困难。
因此支原体衣原体的感染严没有严重，需要对病症进行鉴别。
支原体衣原体感染会影响怀孕：
泌尿生殖道感染支原体后，引起的疾病男性为非淋菌性尿道炎，表现为尿道刺痒、烧灼感和排尿困难，少数有尿频。尿道口轻度红肿，分泌物稀薄，部分病人无症状。女性主要为非淋菌泌尿生殖道炎，表现为白带增多，尿道灼热或引起盆腔炎，输卵管炎等而引起不孕，流产和宫外孕.所以如果发现有此问题，最好是在医生的指导下进行有效的治疗。
支原体衣原体感染会治愈。
由于支原体没有细胞壁，因此对青霉素、头孢素、磺胺类等会产生抗药性，而对四环素、红霉素、阿奇霉素、氟喹诺酮类药物的抗性较强。四环素类、大环内酯类、喹诺酮类等都可以用于衣原体的治疗。阿奇霉素对衣原体和支原体均有良好的疗效，可以作为首选药物。
支原体衣原体感染可能会自愈。
衣原体、支原体是临床上两种比较常见的病原微生物，在感染后，患者可能会有自愈的情况，但取决于患者的身体免疫力。如果患者的免疫力很强，可能会自愈，但如果无法自愈，建议患者及时前往正规医院，在医生指导下进行药敏试验，然后选择敏感的抗生素进行抗感染治疗。
支原体和衣原体是两种不同类型的病原体，部分患者感染后表现为肺炎。临床主要表现为发烧、厌食、咳嗽、畏寒、头疼、胸骨疼痛等，如果是因为支原体感染而造成的。可以口服头孢菌素、青霉素等，这些都是对细菌敏感的抗生素，在医生的指导下使用后有利于缓解患者出现的临床症状。
