骨结核的医治在临床上主要为药物医治，骨结核可分为短骨骨干结核和长骨骨干结核，所谓短骨骨干结核就是指手、足等部位的骨头发生病变。长股骨干主要是大腿、小腿、前臂、上臂部位的结核，短骨骨干的治愈能力比较强，一般可以采取非手术治疗，包括局部注射和石膏托间断固定。
药物治疗，进行抗结核系列的药物治疗，且全程用药，手术治疗，出现脊柱骨折，脊柱结核出现寒性脓肿较大且广泛，伴神经损害，导致肢体瘫痪或关节周围骨结核影响关节功能，需在全身支持疗法、抗结核治疗、营养支持下，进行手术治疗。
骨结核的治疗原则包括全身治疗。全身治疗主要就是抗结核药物的应用，它的原则是联合应用，足量，再一个是足够大的疗程。所谓联合应用就是抗结核药物，目前应用的有雷米封和链霉素，还有利福平、链霉素、乙胺丁醇、吡嗪酰胺等，这种一线和二线的抗结核药物。结核病的治疗有以下几点：
1.全身疗法：使用抗结核药物，主要有利福平、链霉素、乙安丁醇、吡嗪酰胺等。
2.营养支持治疗：多吃富含蛋白、纤维素、高能量食物，以促进结核病的治疗和恢复。
骨结核实际是由于结核病菌造成的一种疾病，结核病虽然大多发生在肺部，但也可以发生在人体的任何器官，发生在脊柱的结核，治疗不及时有可能会导致病人出现瘫痪的问题。关节结核可严重影响关节功能，治疗原则是在抗结核药物控制下，及时彻底的清除病灶，必要时可以联合手术治疗。
骨结核早期治疗大部分是可以治好的。而中晚期的病人，如果骨质严重破坏，并出现各种并发症，就很难治好，甚至危及生命。因此，为了提高治好率，骨结核应该早发现、早治疗。治疗上主要是联合使用抗结核药物。
骨结核的治疗首先应加强全身营养支持疗法高蛋白，维生素，热量要够增强之机体抵抗力，要保证充足的休息这个就是全身抗结核治疗，结合药物应用要足量足疗程。如果疾病发展到严重程度，如脓肿，瘫痪等，就要手术干预，如病灶清除自体骨，再结合抗结核药物治疗。脊柱结核病人，手术风险较大，要慎重考虑选择设备技术条件较好的医院。