碎石对肾脏有一定的伤害，但是伤害都比较小，碎石几乎都会出现肉眼的血尿，血量的多少与碎石所用的能量成正比，还与患者局部毛细血管的脆性有关，正常一般都是2-3次血尿，严重的患者2-3天之后血尿也会自行消失。
一般情况下，激光碎石通常不会影响精子。具体分析如下：
激光碎石是一种用于泌尿道及生殖道结石的手术，主要有肾结石、输尿管结石、膀胱结石、尿道结石、精囊射精管结石等。前四个都是泌尿系结石，激光碎石不会对精液和精子造成任何的伤害。由于精囊和射精管道是由精子和精子经过的地方，所以激光碎石会暂时地起到作用，术后恢复正常，并不会对身体造成什么伤害。
3-5天，碎石后还会痛几天与病人的碎石手术方式，和病人的身体综合素质、小石头的多少、小石头排除的速度、是否用药、病人的喝水多少等因素有关。尿道结石体外碎石后如果排石干净应该不会再疼痛。
长期的体外冲击波碎石可能造成输尿管粘连或者肾脏纤维化，造成肾功能损害或者输尿管狭窄、粘连等。同一部位反复碎石有可能造成输尿管损伤或肾脏损伤，患者出现肉眼血尿或者腹痛症状。体外冲击波治疗较大的结石，可能会产生石阶，导致患者输尿管完全梗阻。体外冲击波碎石治疗时可能因随呼吸活动而定位不准。
0.6cm*0.4cm的大小结石，是否需要碎石治疗，需要根据结石的位置来决定。第一、如果此大小的结石位于肾脏内，则无需体外碎石治疗只需要口服排石药，或者多饮水，多排尿即可。肾脏内侧大小的结石一般不会造成梗阻，也不会有明显的腰腹部疼痛症状，定期复查即可。
体外冲击波碎石术是应用B超或X线进行结石定位，通过测量皮肤与结石之间的距离，调整碎石机，将体外产生的冲击波聚焦于体内的结石位点上，产生一系列的物理学效应，从而使结石碎裂。
