大多数时候病人是感觉不到疼痛的，因为微创巧克力囊肿手术，大多数的时候都是用全身麻醉，手术过程中病人不会感受到疼痛，但是在手术结束后，病人会感受到伤口上的疼痛。在恢复期间，病人可以配合医院的药物，减少疼痛。
女性巧克力囊肿是妇科常见疾病要及时手术的，一般要一两个星期的，术后恢复需要一个月。巧克力囊肿是卵巢的子宫内膜异位症。手术不能治好。术后必须配合药物产生闭经疗法防止复发。
因为巧克力囊肿术后复发率很高，所以术后可以打针延缓复发，一般打的是促性腺激素释放激素激动剂(GnRH-a)。一般在术后第1次来月经的第1-2天开始注射第一针，以后每28天一针，连续使用3-6针。
手术并不能完全去除所有病灶，有些微小的是看不到的，所以确实具有复发的风险，巧克力囊肿实质上是一种子宫内膜异位症，药物治疗效果欠佳，对于生育需求的病人还是首选有实力有经验的大医院微创手术治疗。
巧克力囊肿穿刺是在超声的检查下进行的手术。巧克力囊肿光是做穿刺是不能达到治好的作用，只是一时让囊肿变小而已，卵巢巧克力囊肿首选手术治疗。如果巧囊位置偏下，可试行穿刺术，但穿刺后巧囊极易复发，对妊娠率提高效果不显著，建议行腹腔镜探查术，术中行双侧巧克力囊肿剥除术，术后尽快怀孕的，一般是需要住院治疗的。
5千元-1万元之间，巧克力囊肿是非常多见的妇科疾病，是子宫内膜异位症的一种，一般治疗的不一样，选择医院收费标准的差异，以及患病情况的差异，都会影响到最终的治疗费用。
