扁桃体结石如果张嘴可以明显看到，可以用镊子夹出来，可以到耳鼻咽喉科门诊去取出来的，在耳鼻咽喉科门诊有专门的工具。大部分人都可以取出来的。如果取不出来或者有出血的，就不要盲目去取。就需要通过手术切除扁桃体，才能治疗扁桃体结石的。平时也需要注意保养，尽量避免吃辛辣刺激食物，注意口腔卫生，饭后注意漱口，也可以预防作用。
对于小的扁桃体结石在平时多吃清淡饮食，在饭前、饭后一定要漱口，如果症状不是很明显，就可以饮食注意，注意漱口。如果结石反复引起周围炎症，此时可以考虑用消炎药物局部治疗。如果出现的结石不能通过普通漱口取出，可以用钳子将其取出。如果是比较大的结石，可以考虑在表面麻醉下切开黏膜将结石取出。如果反复出现结石不能完全消除，只能进行扁桃体切除手术。
扁桃体结石一般是发生在扁桃体的上隐窝开口处，当张大嘴时，就会在扁桃体上隐窝，发现淡白色的颗粒样物，打哈欠张大嘴以及挤压扁桃体时颗粒样物可以脱落，质脆，并伴随着臭味。
可以保守治疗，取出扁桃体结石，对于顽固的扁桃体结石保守治疗效果不好，可以考虑扁桃体切除术，能够消除咽部的不适感觉以及口臭。扁桃体结石多发生于扁桃体上隐窝中，长期处于阻塞分泌物引流不畅。
扁桃体结石，如果其只是微小的食物残渣慢慢堆积而成，其可以在饭前饭后以漱口为主，都可以清出来。如果清不出，可以考虑用剜匙或者镊子将比较大的扁桃体结石去除。
小结石可以用刮匙或者钳子取出，个别的可用负压吸引取出。比较大的结石，可在表面麻醉下切开黏膜取出，但需要防止坠入呼吸道。如果结石刺激引起周围的炎症，可以口服消炎类药物局部治疗。对于顽固性的扁桃体结石，保守效果不好，可以行扁桃体切除术。