一般来讲，甲状腺疾病具有很多类型，不同类型的甲状腺疾病会有不同的药物。
如果是甲状腺功能减退，就要用甲状腺素片和左甲状腺素钠进行治疗
如果甲状腺功能亢进，一般是应用甲巯咪唑或丙硫氧嘧啶等抗甲亢药物。
如果是亚急性甲状腺炎，可以用双氯芬酸钠、布洛芬、对乙酰氨基酚等非甾体抗炎药。
而如果是甲状腺结节、甲状腺囊肿等比较严重的疾病要根据情况采用不同的治疗方式。
甲状腺结节治疗办法有外科手术和口服药物。
甲状腺结节首先要考虑进行颈部的弹性超声，看看有没有结节型的肿瘤。此外，还有就是有没有明确的结节型，还有就是有没有弹性分数。甲状腺结节边缘不明确，弹性得分大于4，可以做进一步的超声导向下的穿刺活检，也可以做进一步的手术。术后可以通过肉眼观察到的情况进行术中的快速冷冻和组织切片。如果是甲状腺结节，还要进行血液检查，检查有没有甲状腺功能亢进或者是甲状腺功能下降。甲亢、甲减可以通过口服药物进行调理。在用药过程中，还要注意对病人的甲状腺机能进行监测，防止用药过量导致病情恶化。
常见的治疗亚急性甲状腺炎的药有非甾体抗炎药、糖皮质激素。
亚急性甲状腺炎在没出现发热等症状时，可以只使用非甾体抗炎药进行治疗，同时注意饮食清淡营养、规律运动，调整作息时间。一旦出现剧烈疼痛、发热等症状，需要在医生指导下使用糖皮质激素，如泼尼松，进行治疗。治疗期间要监测血沉、甲状腺功能，及时调整用药。
可用于治疗甲状腺疾病的中药如下：
1、如气滞型可服用逍遥散加减治疗；血瘀型可服用桃红四物汤和碱治疗；痰液凝固型的除海藻玉壶汤加减治疗外，黄药子、土茯苓、野菊花等水煎对甲状腺囊肿也有一定疗效。
2、如玄参、麦冬、桔梗加僵蚕、甘草、青皮、金银花具有清热解毒作用，同时可治疗急性甲状腺炎。发现颈部肿块可煎服生地玄参、麦冬、淮山、牡蛎等药材，既可清热阴又可化痰软坚。
甲状腺结节一般外的药是敷具有清热散结的中药。
连翘、蒲公英、紫花地丁、蒲公英、白花蛇舌草等疏肝解郁、清热解毒、散结祛瘀的功效。可以外用于治疗甲状腺结节，但如果甲状腺结节有异常，需要手术治疗。另外云南白药也可外敷，有活血止痛，散结的功效。另外，在使用外敷药物进行治疗的同时，还可以遵医嘱口服左甲状腺素钠片、丙硫氧嘧啶片、甲基硫氧嘧啶片等药物配合治疗。
一般来说，桥本甲状腺炎应该根据实际情况决定是否用药。
如果桥本甲状腺炎患者的甲状腺功能正常，单纯表现为甲状腺相关抗体增高，一般需药物用药。对于有压迫症状的患者来说，用药一般有左甲状腺素、B_受体阻滞剂等，正确使用一般能辅助控制病情，建议遵医嘱用药。
患者应该注意休息，调整生活方式，不要进行重体力劳动，避免剧烈运动，早睡早起，避免熬夜，保持营养均衡和良好的饮食习惯，饮食以清淡为主，有利于身体恢复。
