尖锐湿疣如果是豆粒大小的丘疹，可以通过冷冻来进行治疗，亚临床感染是不能治愈的，复发率很高。
如果尖锐湿疣表现为肉眼看到的肉瘤，可以采取冷冻，治疗效果较好。如果有新的皮疹，要定期做进一步的检查。同时，冷冻疗法也可能导致局部皮肤红肿，甚至继发感染。恢复的时间要长一些。亚临床感染情况下的皮肤损伤可以通过局部外用药物进行治疗。虽然可以降低复发率，但还是会复发，因此还是要定期去正规的医院就诊。
微波治疗即通过热效应，将辐射针插入疣体，将病变组织蛋白进行凝固分解，从而达到去除疣体的目的。
尖锐湿疣具体的治疗方式，要根据皮损情况而定。如果疣体不是太大，可以选择微波治疗。在治疗过程中，要根据这个皮损的具体情况，选择不同的功率和深度，治疗时把辐射针插入到疣体的基底部，调整适当的功率，使得疣体达到蛋白凝固、皮损轻微发白的状态，将疣体去除后，调小功率，进一步治疗周边的疣体基底组织。
2~3天内就可以脱落的，得了尖锐湿疣首先要调整好心态，千万不要出现过分忧虑，焦急等不良情绪，而影响治疗效果，一旦延误治疗时机，就可能会因病情加重而增加治疗的困难，在治疗上选择方案一定要对症，并在平时生活中，做好病情护理。
尖锐湿疣一般需要做冷冻处理2-3次后大部分皮疹会脱落，也有一些潜伏的病灶很有可能会再次复发。临床上多采用光动力治疗，在做光动力治疗时可以先用冷冻或者是激光将疣体破坏做预处理，然后涂抹上药物进行光动力照射。
光动力治疗一般最少做3次，每次间隔的时间为7-10天，光动力治疗可以明显的减少尖锐湿疣的复发。
除了激光治疗，冷冻治疗法也是尖锐湿疣的常用的治疗办法，方法就是用冷冻的方法可以使尖锐湿疣内部结冰，从而形成组织局部的高度水肿从而破坏疣体，冷冻治疗的最大好处就是局部可以不留痕迹。
尖锐湿疣冷冻治疗后在三天左右的时间会掉。但是这个也要以病情来定的，可以做冷冻治疗后，考虑抗生素预防感染，服用抵抗免疫调节剂或者外用软膏进行治疗，以降低复发机会。
