扁平疣和尖锐湿疣有明显区别，两者病原体都是人乳头状瘤病毒，但是一种是性生活传染病，另外一种是单纯的接触感染。扁平疣在临床相对比较多，在手的位置会起小的米粒丘疹。一般没有其不适，会慢慢恢复。而尖锐湿疣，巨大传染性。第一个就是根据外观来进行区分。还有第二个就是根据这个人乳头状瘤病毒的全套分析，一般扁平疣就是第三和第五两个亚型感染引起的。
扁平疣和尖锐湿疣从症状上不同，外观上也不同的，应该及时去医院检查看看，及时外科检查，才可以确定的，尖锐湿疣一般是局部醋白试验检查，可以确诊的，及时去医院检查的。
两者均属人乳头瘤病毒感染，但尖锐湿疣主要通过性生活传播，扁平疣与免疫力低下有关，其临床表现也有所不同。尖锐湿疣表现为早上肉芽或蔬菜状，而扁平疣是平的。而且要是尖锐湿疣的话，可能是需要去医院进行激光治疗的，所以说如果有的话，还是去医院看一下比较好。
男性尖锐湿疣通常会长在冠状沟、包皮、龟头等部位。
尖锐湿疣是由人类乳头瘤病毒感染引起的一种皮肤粘膜的良性增生，主要是通过性接触传染引起的。男性尖锐湿疣主要发生在肛门和外生殖器部位，主要通过性接触直接传染。它的好发部位一般是外生殖器，主要见于冠状沟、包皮、龟头、包皮系带、尿道口、阴茎体、会阴等，同性恋患者可见于肛门、直肠等部位。
基本损害初起为细小淡红色小疙瘩，大小不一，单个或群集分布，湿润柔软，呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起，红色或污灰色，根部常有蒂，且易发生糜烂渗液，触之易出血。皮损裂缝间常有脓性分泌物郁积其中，致有恶臭，且每因搔抓而引起继发感染。由于不断受到局部潮湿与慢性刺激的作用，往往迅速增长。本病常无自觉症状，部分病人可出现局部疼痛或瘙痒。偶尔可转化为鳞状细胞癌。
