甲状腺肿瘤术后可能会出现一些不良反应，首先是因为手术时嗓子沙，导致喉返神经受损。肿瘤的生长位置和手术操作技巧有关。
还可能会造成低血钙症，也就是所谓的副甲状腺机能低下。甲状腺肿瘤的发生是由于甲状腺肿瘤的侵袭，或是由于局部的血液供应发生变化，从而造成甲状旁腺的功能受损，从而出现手足麻木、抽筋等症状。如果是由于甲状腺肿瘤导致了甲状腺机能亢进，需要尽早进行外科切除。
甲状腺功能减退会造成肌萎缩、甲减性心脏病、高血压和冠心病等多种疾病。甲状腺功能减退症，是指由各种原因导致的低甲状腺激素血症或甲状腺激素抵抗而引起的全身低代谢综合征。主要可以造成人易疲劳、怕冷、体重增加、记忆力减退、反应迟钝、嗜睡、精神抑郁、便秘、月经不调、肌肉痉挛等；还可以造成肌肉的乏力，暂时性的肌强直、痉挛、疼痛，肌肉可以有进行性的肌萎缩；还可以造成心动过缓、心排血量下降、甲减性心脏病；还可以伴发高血压和冠心病。由于甲状腺激素缺乏引起的血红蛋白合成障碍，叶酸的缺乏还可以造成缺铁性贫血，甚至恶性贫血。建议：甲状腺功能减退症必须配合医生积极治疗，如果不进行治疗，会发展成严重的后果。外出时，患者应尽量携带部分食品，以便就餐不及时而补充营养。
甲状腺全部切除后果如下：
1、甲状腺全部切除后，甲状腺激素不能正常分泌，引起手脚发冷、皮肤温度下降、精神萎靡、反应力下降、记忆力下降等甲状腺功能减退症状。此类患者需在医生指导下长期服用甲状腺激素进行替代治疗，必须定期体检调整用量，以保证患者生活质量。
2、同时甲状腺全部切除可损伤周围神经组织，可出现声嘶、吞咽困难、声带轻瘫、瘫痪等后遗症。甲状腺切除手术会在颈部留下疤痕，也影响美观。但甲状腺全切手术时操作不当，可引起术后呼吸困难、颈部肿胀、窒息等急性并发症，需及时处理避免危及生命。
亚急性甲状腺炎的后果是颈部有显著疼痛感，全身有炎症反应，病人可有浑身乏力现象，食欲减退等。
对于这种情况一般都是先进行对症治疗，然后再考虑是否需要使用药物进行治疗，因为很多时候这些症状都是由一种叫做亚甲炎引起的，所以通常称之为亚甲炎。再者是尽管亚甲炎其典型病程分为3期，甲亢和甲减期，也有恢复期，多数病人甲状腺功能均能恢复正常，但有极个别病人亚甲炎后留下永久性甲状腺功能减退。另外还有部分患者在经过了一段时间的治疗后，其症状仍然没有改善，并且病情还进一步加重，最终发展成甲状腺癌或者是转移癌等严重并发症。这部分病人屈指可数，但若有必须给终身甲状腺激素替代治疗。
一般情况下，甲状腺肿大的后果有压迫气管、阻碍头部静脉等，具体内容如下：
甲状腺肿大一般不会表现出任何症状，严重肿大时，压迫气管会导致咳嗽、吸气性喘鸣、气管偏移狭窄，压迫到食管会导致吞咽困难，压迫到喉返神经会导致嗓音沙哑。胸骨后的甲状腺肿会阻碍头部和上腔静脉，从而性甲状腺肿还会导致血液循环中的甲状腺激素过量，导致全身神经、循环、消化等系进，还会出现烦躁、心悸、失眠、怕热、多汗等症状。
甲状腺切除可能导致甲状腺功能减退症、喉返神经损伤、甲状旁腺功能减退症等多种后果。
甲状腺由于周围血管和神经分布丰富，容易出现后遗症，常见的是喉返神经损伤。如果切除术中碰到喉返神经。损伤小的患者可表现为术后声嘶、发音障碍，严重的患者可表现为呼吸困难、窒息。同时甲减也是最常见的后遗症，表现为乏力、反应力下降、体重增加、运动迟缓、粘液性水肿等症状。
