胚胎停育的原因主要有四个方面。生殖内心泌方面，因为胚胎早期发育的时候，需要三个重要的激素水平，分别是雌激素，孕激素，绒毛膜促性腺激素，如果母体自身的内源性激素不够，就满足不了胚胎的需要，就会造成胚胎的停育；生殖免疫的问题，如果自身有某种抗体，就会抵制胚胎的发育等。
胎儿停育的检查分为男性和女性。男性需要检查染色体，精子质量，精子形态，支原体衣原体，淋球菌。女性需要检查染色体，基本激素，甲状腺功能，催乳素，触觉等。由于医疗发展有限，四分之一的仍无法找到原因。
如果发生胚胎停孕，孕母的一切妊娠反应都会逐步消失。首先是不再有恶心、呕吐等，最后还可能出现下腹疼痛，排出胚胎。表现因人而异，有的甚至一点迹象都没有就直接出现腹痛，然后流产，或胚胎停孕后无症状通过常规B超检查发现。
胎动减少，胎动是胎儿生命的最客观的征兆之一，是胎儿给母亲发出的信号。因此，孕妇经常掌握胎动情况，可以了解胎儿的安危，及时发现问题。妊娠16-20周，胎儿开始了能被母亲感知的明显的胎动。随着孕周的增加，胎动也在增加。
早期胚胎停育，首先考虑染色体异常，注意夫妻双方先查染色体，另外，女方可以查一下内分泌，比如甲状腺，还有激素水平，还有夫妻双方的支原体，衣原体等。胚胎停育也称为稽留流产，可能的病因有很多，如染色体异常、免疫排斥、生殖道感染、子宫畸形、环境因素等。
