良性或早期者无症状，晚期常见症状有腹痛、包块及消化道出血及胃肠道梗阻等。腹腔播散可出现腹水，恶性GIST可有体重减轻、发热等症状。胃肠道间质瘤也是常见的胃肠道肿瘤，恶性程度也会有较大的差异，和癌细胞的分裂程度，和核分裂象都有直接的关系。
分为一代靶向药物、二代靶向药物、三代靶向药物。能够非常有效的抑制癌细胞，也能有效的杀死癌细胞，胃肠道间质瘤可能会导致胃胀或者是胃酸，严重的还可能会出现腹泻的现象。一定要及时治疗。
胃间质瘤即是一种发生于消化道的少见的肿瘤，它属于间叶肿瘤的一种。只要身体条件允许，没有转移，应首选手术，手术后完全可以康复的。以后重在预防复发，不使用致癌物质，像腌制的东西油炸的尤其，像花生，腐烂的水果等，多吃新鲜的果蔬。
如果是胃肠道间质瘤的情况，那么考虑这个时候出现有骨转移的话。胃肠道间质瘤的治疗。具体的是手术联合靶向分子药物的综合治疗方法那么这个时候出现转移，考虑是需要结合病理的情况。遵医嘱进行进一步的治疗改善的。
分期为极低危险度或低危险度的胃肠道间质瘤患者，术后复发或转移的风险较低，一般不需要进行术后的。辅助化疗。部分为中危险度或高危险度的患者，需接受术后的辅助化疗，应口服药物2—3年。坚持术后随访，定期复查。
胃肠道间质瘤术后是需要吃药的，因为术后也是会有一定转移的复发几率，为了把转移和复发率降到最低，所以术后需要用药，中度风险的患者吃药的时间在一年左右，如果是高度复发风险的病人可以吃三年以上。