生殖器疱疹是会导致腰疼的。无论是吃药、输液、手术、冷冻、还是激光治疗等，对生殖器疱疹缓解临床症状和抑制病情确实起到了一定作用，有的经过治疗疱疹也消失了，表面看起来好像是治好了。但都忽视了深层次清除病毒、重建机体免疫、杜绝生殖器疱疹复发重要环节，生殖器疱疹的复发不可避免。
出现这种病情和生殖器疱疹有关系，另外也可见于坐骨神经痛，腰椎病变等导致，出现疼痛，可以服用药物治疗，到医院外科再复查一下腰椎片等检查看是否有异常，根据检查进行治疗。
生殖器疱疹会出现疼的想想，生殖器疱疹感染潜伏期约为3～5天，患部先有烧灼感，出现红斑，很快在红斑的表面发生3～10个成簇分布的小水疱，数日后成为小脓疱，破溃后形成糜烂面和浅溃疡，局部红肿，有烧灼样疼痛。建议早发现早治疗，不要讳疾忌医。
生殖器疱疹是由单纯性Ⅱ型疱疹病毒引起，这种病毒相当顽固，要治疗，必须把以内的毒素彻底杀死即可治疗，采用可使体内产生大量的内源性传统中药配合治疗，可以阻断疱疹病毒DNA的复制，就像给人结扎一样，使其不能产生新的病毒。
平时可以选择穿宽松的内衣，比较好的棉内衣，不能穿尼龙内衣。还可以用盐水浴清洗生殖器部位，能够清洁干燥皮损。最后还可以平时冻点冰块，冰块可以敷到疱疹的地方，也可能缓解疼痛的。
问题分析：这个情况有可能是发生性关系，没注意卫生，有细菌感染，所以才会导致出现阴茎部位出现疼痛不适的现象，
意见建议：如果患有生殖器疱疹没有带避孕套这个情况的话是有可能会传染给对方，目前的话建议观察一下，可以适当的服用盐酸左氧氟沙星消炎，
