可以通过做活检穿刺的病理检查区别肾肿瘤的良性与恶性。一般良性肿瘤的生长速度是非常缓慢的，恶性就会出现快速生长，而且还会出现转移的情况，良性肿瘤一般对身体不会造成很大的影响，如果是恶性就会威胁到生命，所以恶性肿瘤需要通过化疗抑制癌细胞的生长。
多囊肾和肾囊肿有本质性的区别，多囊肾是一种先天性遗传性疾病，目前的发病机制不清楚，肾小管梗阻有关，与肾单位不同部位的局部扩张有关。肾囊肿是一种后天性的疾病，它的发病机制是一段扩张的肾小管逐步增大，形成囊肿，会有多囊肝，囊肿是相通的，在肾脏会布满各种各样的囊肿，导致肾功能衰竭。肾囊肿多数为单发，或者散在多发，不会导致肾功能衰竭。
肾结石与肾囊肿的B超检查截然不同，具体区别如下：
肾脏囊肿与肾结石是两种截然不同的病症，其病因及发展与此种预后疗法截然不同。这两种病都有自己的特征，常规的尿路检测，一般都会进行b超的无创性和最简便的筛查。b超是一个非常有规律的囊肿，里面充满了液体，有一个很大的囊。超声波是指利用超声波的反射，来研究其内部的结构。肾结石大小不一，在超声波中，是一个很大的亮点，在后部，会出现一些强烈的回音。常规的B超是最常见的。有一项叫做KUB的腹部平片，结石位于肾部位，会呈现高密度影的不规则图像，正常的时候是看不到的，但是ct检查会更加清晰，特征也更加突出，这是一个高密度的肾盂肾盏。结石的形状和部位都是非常清晰的，囊肿是一种密度很高的液体，很容易分辨。
要是通过影像学等各种检查怀疑肾脏恶性肿瘤，手术切除后要送病理检查，病理诊断能够定性也能够确定肾癌类型，所以说肾癌的具体类型就是通过病理诊断来确定的。肾癌最常见的就是透明细胞癌，其次就是乳头状肾细胞癌，肾透明细胞癌治疗起来比较棘手，对放化疗不是要特别敏感。
肾囊肿与多囊肾的区别主要是发病原因不同，多囊肾是一种先天性遗传性疾病，与肾小管梗阻有关，或者与肾单位不同部位的局部扩张有关，而肾囊肿是一种后天性的疾病，它的发病机制是一段扩张的肾小管逐步增大，形成囊肿。
