一般没有治疗病毒感染性疣的最好方法，有效的方法主要是药物或者是物理治疗。
病毒感染性疣通常为人乳头瘤病毒感染所致，其临床可分为许多类型，如寻常疣，跖疣，扁平疣，尖锐湿疣，传染性软疣等。寻常疣、跖疣等主要采用冷冻或激光去除，扁平疣通常外涂药物。传染性软疣需夹去疣体内部软疣小体才能根治，尖锐湿疣则需采用冷冻，激光，手术或光动力等疗法。
通常生殖细菌感染用抗感染的药物较好。
如果是泌尿系的疾病，可以选择诺氟沙星、左氧氟或头孢等抗生素，但需提前进行药物敏感性实验，并根据医生的建议规范用药。在这个治疗过程中，病人要避免吃一些辛辣刺激性的东西，保证饮食清淡，有助于达到较好地治疗效果。
生殖器感染者应服用抗感染药物调理。
若发生生殖系统感染，可选用诺氟沙星胶囊，左氧氟类或头孢类用药处理，还可进行药物敏感试验，结合药敏试验结果，在医师指导下，选用适当用药。治疗期间患者要注意保持清淡饮食，不要吃辛辣、刺激性食物，有利于身体的恢复。
如果出现生殖感染，可以选择莫匹罗星软膏、酮康唑软膏等。它们都是有抗菌作用的，可以起到一定的治疗效果。
在使用莫匹罗星软膏、酮康唑软膏前，应注意在医生指导下进行，做好生殖器卫生护理，保持干燥洁净，避免同房，用药期间有任何不适应立即停止用药，并前往医院就诊。
生殖感染一般吃罗红霉素、多西环素、米诺环素等药物最好。
生殖感染的患者应该遵医嘱使用抗感染的药物进行治疗，大多与细菌感染有关，因此建议使用广谱抗菌素治疗，比如罗红霉素、多西环素、米诺环素等。可以起到抗菌消炎的作用，从而达到治疗效果。
患者日常要遵医嘱按疗程用药。
生殖器感染通常可按病因进行药物治疗，生殖器感染又有男性生殖器感染和女性生殖器感染之分。
1、男性生殖器感染：男性生殖器感染多由病毒、细菌或真菌感染引起，通常对症用药。若为细菌感染，一般可选用抗生素类药物，例如，盐酸多西环素胶囊或盐酸莫西沙星片。如果是病毒感染，需使用抗病毒药，比如阿昔洛韦片、泛昔洛韦片等。
2、女性生殖器感染：女性生殖器感染以真菌和细菌感染为多见，可能引起白带异常等病症，需要选择用适当药物进行治疗，例如，细菌感染用甲硝唑栓或替硝唑栓治疗。真菌感染用氟康唑胶囊治疗。