心房颤动最常见的并发症通常是栓塞。
心房颤动最常见的并发症就是栓塞，尤其是脑动脉栓塞。心房颤动的发病率在2%-6%之间，而房颤的病人有75%概率出现脑动脉栓塞。此外，在心房颤动的影响下，病人也可能出现周围动脉栓塞的情况，80%周围动脉栓塞患者会有心房颤动，因为房颤病人的心脏附壁上的血栓脱落，血液会随着血管内的血液流向周围的血管而发生栓塞。因此，出现心房颤动后要及时治疗，以免发生并发症。病人平时要多休息，要保持心情稳定，不要过度劳累。
心房颤动治疗强调长期综合管理，即在治疗原发疾病和诱发因素的基础上，积极预防血栓栓塞、转复并维持窦性心律及控制心室率，医生会根据病因、临床症状不同等给予药物、手术或者射频消融治疗等不同的治疗方案。
对于已不适合药物转复或药物及电复律转复失败的老年患者，治疗目的则是控制心室率。目前常用药物有洋地黄、β受体阻断药、钙通道阻断药、胺碘酮等。中医药对房颤的主要干预手段有药物治疗、针灸疗法等，例如参附注射液，温补心阳，安神定悸。用于心阳不振所造成的心慌不安、胸闷气短。
持续性房颤的治疗涉及到其病因的治疗。与甲状腺功能亢进一样，甲状腺功能亢进可引起持续性房颤，因此治疗甲状腺功能亢进有助于持续性房颤的治疗。控制心室率，重建窦性心率，预防栓塞。由于地高辛能增加房室传导的延迟和阻滞，故通常可通过地高辛控制心室率。例如，独自地高辛不够有效。维拉帕米(维必定)最有效。
心房颤动诊断要点，包括以下几点。
一、心电图显示p波消失而代之以微小的f波，f波更容易被v1及II导联所识别，f波频率为350至600次分，R-R间期绝对不规整。
二、体格检查，心律肯定不齐。第二心音微弱或消失，第三心音增强或弱而无力。第一心音有强有弱，有短拙脉。第二心音微弱或杂音，无明显心律失常者。心率相差相对较大，视房室传导而定，心率以缓慢型或快速型为主。
有的心房颤动能根治，如孤立性房颤、阵发性心房颤动等，对此种情况可先考虑转复，转成窦性心律后，若日后不再发作，则算根治。
如转复失败，亦可行射频消融术（RFA）.射频消融术成功率可达甚至更高，获得成功后亦等于痊愈，但对持续性心房颤动（房颤），和永久性心房颤动（房颤），则难以根治，通常仅采用控制心室率和抗凝等方法。
