目前尚无针对性治疗传染性软疣药物，如西多福韦软膏和咪喹莫特乳膏均能起到一定的治疗作用，但其具体作用个体差异较大。
临床上对传染性软疣的治疗主要以物理疗法为主，药物治疗由于作用缓慢，且尚无明确针对传染性软疣的治疗药物而较少使用。但是抗病毒药物、免疫调节剂和其他外用药物能起到一定的治疗作用。
传染性软疣应该涂抹水杨酸软膏、维A酸软膏、红霉素软膏等药膏。
传染性软疣病毒经皮肤、污染物或其本身种植所扩散的病害，如果患者不小心染上了这种疾病，可以在医生的指导下涂抹水杨酸软膏、维A酸软膏等药物进行治疗，如果患者不注意日常护理，出现了感染的情况，还可以按医嘱涂抹红霉素软膏。
此外，患者应该合理饮食，避免吃辣椒。
发生传染性软疣时，可施用酞丁安软膏、咪喹莫特乳液、五氟尿嘧啶乳膏和其他药物治疗。在对患儿进行有效的护理之后，可采取隔离措施以防止病毒扩散到周围的环境中。传染性软疣为病毒感染所引起的皮肤疾病之一，好发于儿童，也好发于免疫力低下者，必要时可采用激光、电灼等方式进行治疗。
可能与局部感染有关系。到医院肛肠科检查一下，可以做肛门指诊检查，肛镜检查，彩超检查，血常规检查等。查找病因对症治疗。如果确诊为肛周脓肿。可以静脉输入抗生素类药物，暂时保守治疗，也可以手术治疗，生活中注意调养。
该药物绝对不能应用于伤口，可以应用静脉注射。不能用酒精消毒的，因为会刺激外阴而产生疼的，穿宽松内裤，不要碰触创面，抽时间去医院化验阴道分泌物。如果伤口没有感染，外用药物没什么用处。是抗生素。仅是抗感染作用。
不同致病微生物引起的生殖感染，使用的药物不同。
如果是细菌感染引起的生殖感染，可以口服克拉霉素、头孢曲松等抗生素进行治疗，能够抗菌的作用。如有真菌性生殖感染，可以口服氟康唑、伊曲康唑等。药物进行治疗，能够起到抗真菌的作用。
发生生殖感染，一定要严格按医师指导的用药。还要经常去正规的医院做检查，适当的调整药物用量，这样才后能更好的缓解症状。
