注射乙肝疫苗后，人体免疫系统会对疫苗中的蛋白质抗原产生反应，一般在注射疫苗后大约一个月左右就会产生抗体，刚开始抗体水平很低，到了第二针，抗体水平就会迅速上升，很快就能抵抗乙肝病毒感染。接种乙肝疫苗后，从理论分析半个月后会逐渐产生抗体。不过早期抗体的浓度比较低，接种三针结束后，90%以上的患者都会出现保护性抗体。
乙肝抗体在体内能够维持的时间和乙肝表面抗体的定量有关，如果该抗体定量＞100miu/m，能够维持的时间一般在5-7年左右，抗体定量＜30miu/m，则只能维持半年到1年左右的时间，患者可以测定自身抗体的定量，体内抗体滴度降低时，及时进行加强接种。
不接种乙肝疫苗并不意味着没有抗体形成。如果长期暴露于乙型肝炎的没有被感染，这也将导致某些抗体和乙型肝炎抗体的形成。这与疫苗接种有关。然而不接种疫苗并不意味着不会形成抗体。这两者之间没有绝对的关系。
孕期可以打乙肝疫苗但是不在迫不得已的状况下不要打。应该检查看看是否有乙肝抗体没有的话就做好这个乙肝的预防工作，注射乙肝疫苗，一般要等注射疫苗三个月之后再怀孕，尽量降低风险。
不存在乙肝疫苗抗体的说法，如果有乙肝抗体，通常不用打疫苗。
目前临床上还没有乙肝疫苗抗体的概念，只有乙肝表面抗体，乙肝两对半的检测结果是乙肝表面抗体阳性，则说明存在乙肝表面抗体，此时不需要再打疫苗。不过，也有一个特殊的现象，那就是随着时间的流逝，乙肝表面抗体的浓度会降低，或者会转成阴性。因此，如果有乙肝的高危因素，即患者的家人有乙肝病毒感染，应定期进行乙肝两对半的检查，如果发现乙肝表面抗体转阴，需要再次接种乙肝疫苗，以便得到乙肝表面抗体的持续阳性，从而降低乙肝的感染几率。
目前常用的注射方法是0、1、6月注射法，即第二针在打完第一针后1个月注射，第三针于第一针后6个月时注射。每次皮下注射5―10微克。第七个月时，应化验乙肝五项检查接种效果。如果乙肝表面抗体呈阳性，即为有效。乙肝表面抗体是一种保护性抗体，能保证人体对乙肝病毒具有免疫力。
