乙肝患者打干扰素的副作用最常见的是发热及流感样综合征，患者体重减轻、脱发、情绪激动，骨髓抑制致血细胞、血小板减少，轻度贫血，偶可发生神经系统损伤，影响内分泌系统功能，亦有产生干扰素抗体者。
乙肝打干扰素转阴概率是百分之五十，一般是长效干扰素。即在治疗过程中，一般是6个月，表面抗原低于1500IU/ml，这部分病人最终实现临床治愈的比例要明显升高，也就是乙肝能阴转。
乙肝疫苗不良反应，可能是局部反应，也可能会出现全身性症状。
1.局部反应：部分婴儿，特别是对该产品有敏感的人，会在注射24个钟头后，局部红肿、发痒、硬结等症状会慢慢消退。
2.全身性症状：发热、肌肉酸痛、恶心、食欲不振、精神不好、腹痛、腹泻等不良症状，症状在24个月后就会消失。
需要注意的是，接种了乙型肝炎疫苗并不是所有的人都会有抗体。有的人接种后不会生成抗体，建议到医院做个乙肝五项目的检测，看有没有产生抗体。
乙肝干扰素通常需要打一年左右，但具体注射时间需要根据具体病情来判断。
乙肝打干扰素的疗程通常要看具体的情况。在注射干扰素的过程中，如果病毒的浓度降低的比较好，表面抗原的含量降低的比较好，一般打一年左右即可。如果一年之后，表面抗原的含量还在不断的降低，那么可以通过延长疗程来促使乙肝表面抗原的转阴，可以延长至72周-96周。但如果使用干扰素不起作用，可以在3个月后停止使用，可以服用核苷类的药物。
一般来说，婴儿打乙肝后不良反应主要有以下情况。
乙肝疫苗一般需要打三针，打完三针疫苗之后，才能有比较稳定的对乙肝的免疫能力。乙肝疫苗的不良反应。婴儿打乙肝后不良反应通常有注射部位的疼痛症状，但一般不会出现压痛、红肿等症状，一天左右的时间就能消失，也可能持续到两到三天的时间。症状严重的，局部有可能会起硬结。此外，还可能出现轻微的发热症状，以及过敏性休克。
乙肝是常见的疾病，慢性乙肝最主要的表现就是乏力，觉得劳累，有时候发现皮肤发黄，眼睛的白眼珠、巩膜发黄，发现尿黄，有时候有一些上消化道的症状，像恶心、呕吐或者食欲不振。有的可能出现大便、腹泻的一些状况，还有一些伴发肝区的疼。
