乙肝停药主要包括抗病毒，包括口服核苷类药物和干扰素抗病毒。干扰素抗病毒停药的标准要结合实际情况来定。
一般来说，大三阳转成小三阳，病毒检测不出来，而且疗程满一年，乙肝表面抗原也没有下降的迹象，可以停药。如果乙肝表面抗原持续下降一年，那么干扰素的疗程可以延长到一年半到两年，因为有可能出现乙肝表面抗原转阴。如果是口服核苷类药物，至少要治疗四年以上的乙肝大三阳，大三阳到小三阳的治疗至少需要三年以上的时间。乙肝小三阳患者需要口服核苷类药物，直到乙肝表面抗原转阴。
乙肝大三阳是乙型肝炎的相对比较重的病理状态，肝功能正常的患者仍旧需要接受治疗。
在HBV的血清学检测中，发现乙肝表面抗原和中心抗体呈阳性，表示身体受到了HBV的影响，HBV的E抗原呈阴性，说明人体的肝脏和血清中的乙肝病毒的增殖活动，这个时候人体内的病毒浓度很高，并且有很高的传染性，因此，如果肝功能没有问题，还需要使用抗病毒的药物，并且在使用抗病毒药物后，不能随便停药，如果是乙肝表面抗原转阴性，那么就可以停止使用。
因此，对于乙肝大三阳的治疗，要根据病人的情况，根据病人的情况来进行，如果肝脏的功能和肝脏的形态结构都是正常的，此时已经达到了免疫耐受期，可以暂时不需要进行治疗。当肝脏功能出现异常或病毒呈阳性时，可以进行抗病毒治疗，在抗病毒治疗时，应首选干扰素抗病毒治疗，干扰素抗病毒治疗是有治疗目的，可以停止使用，同时表面抗原转阴的几率也很高。
大三阳，HBVDNA阳性，肝功不正常或经微波动，但ALT(或AST)小于正常值上限的二倍。应该做肝穿活检，如果肝内有炎症和纤维化(大于G2或大于S2)就应该抗病毒治疗。如果不愿意做肝穿活检，暂时可些保肝药，或不用药观察，在观察过程中，如果遇到ALT升高大于正常值上限的2倍，即开始抗病毒治疗。
乙肝大三阳患者有病毒的复制，不经过积极的治疗，一般不会自愈。患者此时需要进一步抽血查乙肝DNA以及肝功能，必要时候查上腹部的彩超以及胃镜检查。如果乙肝DNA提示病毒有复制，而且合并有谷丙、谷草转氨酶的升高。此时就要积极的考虑行抗病毒治疗，可以口服药物。
乙肝患者要定期做肝功能和B超检查，因为乙肝大三阳中有10%-20%的人会发生，所以要定期做检查，及时治疗。乙肝大三阳一旦发生，需要进行抗病毒治疗，主要有两种，一种是注射干扰素，一种是一周一次的长效干扰素，一周一次的短效干扰素，两天一次，持续2年。第二种是口服的核苷类抗病毒药物，目前临床上常用的有恩替卡韦、替诺福韦等，其治疗周期不确定，一般需要3-5年以上。
