通常情况下，川崎病的后期要注意心脏的损伤。
因为川崎病可能会造成儿童的冠状动脉的扩张，还有冠状动脉瘤、心律失常的损伤。所以一般需要定期给患者检查心电图。其次，是继续应用抗凝药物，因为在川崎病的后期，通常也会造成患者的体内存在高凝状态。此时，往往仍然需要长期的应用潘生丁、阿司匹林等药物进行治疗。并且需要在应用抗凝药物的同时，要注意给患者动态检查血小板计数，血沉，凝血功能等。
川崎病好转后需要定期门诊随访，主要是川崎病属于风湿免疫系统疾病，免疫功能恢复需要一段时间，需要定期复查血常规、血沉、C反应蛋白等；同时还要注意孩子的心脏情况，尤其是心脏冠脉的情况，定期复查心脏彩超、心电图等；定期服用阿司匹林片；在心脏冠状动脉恢复正常前，要避免剧烈的运动和激动，保持将的生活方式，起居有度，夜卧早起。
川崎病后期主要以冠心病为主。冠脉发炎会慢慢消失，并会有纤维组织的生长。在此期间，患者需要注意预防感染、药物治疗、定期复查、超声波检查等，具体情况分析如下：
1.预防感染，避免再犯；2.给予阿司匹林，直到其冠脉恢复到原来的水平；3.对患有冠心病的患者进行严密追踪，术后1、3个月及5个月后进行复查。4.对于没有冠心病的儿童，应经常进行心脏电波及心脏超音波检查。
川崎病的宝宝饮食上应供给充足的各种维生素，避免过热和味道刺激的食物。饮食上还应给予富有营养、清淡和易消化的食物。川崎病是一种血管炎综合症，常常发生在五岁以下的幼童，主要诊断还是要结合临床检查结果和症状来判断，如不间断高烧39到40C超过五天，是诊断川崎病的前提条件。
川崎病是一种自限性的疾病，大部分病人的预后都很好。
一般只有1%-2%的儿童会发生川崎病的复发，而那些没有发生管状动脉病变的孩子，一般会在1个月、3个月、6个月、1-2年进行一次全面的身体检查，包括身体检查、心电图、超声心动图等。如果没有得到有效的治疗，约15%-25%的儿童会患上冠状动脉瘤，因此，应该在6-12个月内进行长时间的跟踪。冠状动脉瘤在发病后2年内会自行消失，但仍会出现血管壁增厚、弹性减退等功能障碍。较大的动脉瘤往往难以完全消退，经常会造成血栓和官腔狭窄。
要加强消化道的管理，多食用高营养、易消化的食物。主张以高热量、高蛋白、高纤维素的流食或半流食为主，如鸡蛋糕、果汁、饮料、豆浆等，避免食用生冷、硬、过热、辛辣的刺激性食物。急性发作期以少量流食、多餐为主，必要时充分补充营养物质。
