功能性囊肿：这是最常见的囊肿，出血性囊肿：有时滤泡囊肿及黄体囊肿生长过速，造成卵巢的组织牵扯而裂开流血，浆液性上皮囊肿及黏液性上皮囊肿，巧克力囊肿(子宫内膜异位瘤)，畸胎瘤，卵巢癌，子宫内膜样瘤。
许多女性都有可能患有宫颈囊肿，但大多数囊肿形成之后就不再变化，最恶变的可能性比较小，所以如果没有对生活造成什么影响，不治疗也没关系，只要定期复查，观察囊肿的生长情况就可以。如果病人出现阴道分泌物增多，且呈粘稠脓液状，外阴骚痒有灼热感等症状可以考虑为宫颈囊肿。
巧克力囊肿的类型有，高雄激素血症，稀发排卵和B超提示多囊卵巢，高雄激素血症，稀发排卵，但B超提示卵巢正常，高雄激素血症，B超提示卵巢多囊，稀发排卵，B超提示多囊卵巢，但无高雄激素血症。
卵巢囊肿有生理性的，也就是较大的卵泡检查，有可能会出现这一种症状，如果非排卵期出现卵巢囊肿，表示实质性的卵巢囊肿，有可能会影响卵巢的功能，甚至会造成输卵管堵塞。
||型巧囊可能是种植于卵巢表面的异位灶侵犯到原已存在的功能性囊肿如黄体囊肿等形成的。这种巧囊通常较大，囊壁也比较清楚，剥离起来比较容易；|型巧囊（通常小于2cm）是由逆流的经血碎片种植于卵巢表面形成的，很象腹膜上的病灶。这种小巧囊通常没有明显的囊壁，反而不容易剥除。
巧克力囊肿是子宫内膜异位到卵巢形成的，是没有什么分类的，随着月经来潮，囊肿会越来越大，主要表现为经期腹痛。巧克力囊肿容易引起盆腔粘连，输卵管粘连，甚至影响怀孕。
